More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00971 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  100 
 
 
558 aa  1153    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  35.4 
 
 
487 aa  278  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  31.6 
 
 
471 aa  250  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  33.71 
 
 
470 aa  233  6e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  32.68 
 
 
479 aa  225  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  29.85 
 
 
472 aa  219  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  29.61 
 
 
462 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  30.3 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  28.57 
 
 
539 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  30.49 
 
 
500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  30.26 
 
 
467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  30.6 
 
 
452 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  28.87 
 
 
440 aa  191  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  29.61 
 
 
457 aa  190  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  31.15 
 
 
491 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  30.43 
 
 
465 aa  187  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  29.48 
 
 
482 aa  187  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  30.28 
 
 
438 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  30.21 
 
 
457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  28.42 
 
 
553 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  28.94 
 
 
453 aa  183  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  28.24 
 
 
442 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  30.74 
 
 
551 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  30.23 
 
 
548 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  28.57 
 
 
442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  27.34 
 
 
510 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  28.11 
 
 
517 aa  172  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  29.54 
 
 
486 aa  171  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  28.75 
 
 
492 aa  170  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  28.69 
 
 
631 aa  169  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  28.72 
 
 
490 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  29.49 
 
 
495 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  26.42 
 
 
478 aa  167  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  28.93 
 
 
543 aa  166  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0390  sulfatase  26.81 
 
 
464 aa  166  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  28.54 
 
 
535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  28.54 
 
 
535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  28.54 
 
 
535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  26.97 
 
 
536 aa  161  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  30.86 
 
 
491 aa  160  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  29.25 
 
 
474 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  27.52 
 
 
483 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  27.49 
 
 
453 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  29.25 
 
 
466 aa  159  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  28.09 
 
 
484 aa  158  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  27.31 
 
 
559 aa  158  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  25.37 
 
 
563 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  29.49 
 
 
501 aa  156  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  28.48 
 
 
627 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  26.78 
 
 
543 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  25.67 
 
 
470 aa  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  27.35 
 
 
481 aa  154  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  26.93 
 
 
458 aa  154  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  25.56 
 
 
571 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  27.63 
 
 
459 aa  153  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  28.6 
 
 
481 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  25.73 
 
 
523 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  24.79 
 
 
497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  26.1 
 
 
506 aa  149  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  26.43 
 
 
520 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  26.92 
 
 
523 aa  146  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  24.04 
 
 
542 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  29.89 
 
 
457 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  26.02 
 
 
489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  25.35 
 
 
581 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  27.62 
 
 
462 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  26.06 
 
 
468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01110  arylsulfatase A family protein  26.13 
 
 
480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  27.75 
 
 
486 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  27.7 
 
 
513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  27.02 
 
 
460 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  26.68 
 
 
500 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  25.56 
 
 
519 aa  134  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  25.78 
 
 
506 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  26.34 
 
 
497 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  27.59 
 
 
500 aa  133  7.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  26.34 
 
 
497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  26.34 
 
 
520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  27.76 
 
 
503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  24.21 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  26.34 
 
 
497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  26.35 
 
 
497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  24.76 
 
 
553 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  23.89 
 
 
638 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  27.31 
 
 
497 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  26.65 
 
 
497 aa  128  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  25.89 
 
 
453 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  23.49 
 
 
563 aa  127  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  25.41 
 
 
493 aa  127  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0381  sulfatase  24.62 
 
 
778 aa  127  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  23.29 
 
 
533 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  26.4 
 
 
551 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  26.19 
 
 
517 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  23.79 
 
 
542 aa  124  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01456  hypothetical protein  29.82 
 
 
560 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1583  sulfatase  29.82 
 
 
560 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2159  sulfatase  29.82 
 
 
560 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01469  hypothetical protein  29.82 
 
 
560 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1675  sulfatase  29.82 
 
 
539 aa  124  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  25.51 
 
 
555 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>