More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00968 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  47.45 
 
 
958 aa  693    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  100 
 
 
731 aa  1532    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  46.71 
 
 
733 aa  630  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  52.58 
 
 
632 aa  617  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  52.39 
 
 
1509 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  54.1 
 
 
709 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  54.1 
 
 
709 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  51.5 
 
 
1275 aa  571  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  50.38 
 
 
625 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  50.38 
 
 
625 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.32 
 
 
1561 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  44.35 
 
 
625 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  48.58 
 
 
723 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 
765 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  43.84 
 
 
1152 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  39.41 
 
 
746 aa  501  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  43.84 
 
 
1152 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  41.36 
 
 
1334 aa  477  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  44.09 
 
 
1067 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  44.07 
 
 
710 aa  465  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  43.62 
 
 
717 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  43.62 
 
 
717 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  43.44 
 
 
721 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  45.66 
 
 
775 aa  438  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  33.38 
 
 
734 aa  435  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  43.4 
 
 
728 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  37.73 
 
 
658 aa  423  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  40.24 
 
 
1486 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  38.92 
 
 
794 aa  414  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 
880 aa  405  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  38.79 
 
 
832 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  39.38 
 
 
1991 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
742 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  43.39 
 
 
602 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  39.2 
 
 
810 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
742 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  39.2 
 
 
996 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
742 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  36.93 
 
 
790 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  38.32 
 
 
1182 aa  365  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  37.07 
 
 
988 aa  364  3e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  43.76 
 
 
576 aa  362  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  36.94 
 
 
857 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.11 
 
 
610 aa  351  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  37.38 
 
 
783 aa  350  4e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  36.77 
 
 
1084 aa  349  1e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  36.81 
 
 
983 aa  348  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  34.28 
 
 
958 aa  316  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 
586 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.29 
 
 
809 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  38.34 
 
 
796 aa  301  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 
808 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  34.44 
 
 
617 aa  291  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  37.24 
 
 
1759 aa  291  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
684 aa  290  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  34.46 
 
 
1359 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  36.85 
 
 
531 aa  282  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
670 aa  272  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  31.92 
 
 
2046 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
652 aa  268  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  35.49 
 
 
635 aa  264  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 
526 aa  259  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 
732 aa  258  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
725 aa  257  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  30.75 
 
 
1644 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  30.75 
 
 
1644 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 
539 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
653 aa  253  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
729 aa  252  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  34.53 
 
 
551 aa  252  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 
725 aa  252  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
684 aa  251  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 
556 aa  249  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
555 aa  245  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  34.3 
 
 
632 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 
1198 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 
551 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
783 aa  237  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 
662 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
1193 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1043  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
1009 aa  216  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0124689  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
1297 aa  215  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
974 aa  212  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  28.49 
 
 
1213 aa  211  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
748 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
1190 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  29.94 
 
 
1188 aa  209  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  31.26 
 
 
784 aa  207  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
1177 aa  207  8e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.99 
 
 
968 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
968 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  27.92 
 
 
1694 aa  203  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.59 
 
 
1191 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.54 
 
 
1173 aa  193  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
1187 aa  185  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  28.52 
 
 
1171 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3348  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
1074 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861977  normal  0.0615574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
1162 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  38.06 
 
 
972 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
1192 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.891442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>