20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00902 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00902  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  300  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0909  hypothetical protein  47.62 
 
 
147 aa  131  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.384444  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5132  hypothetical protein  38.53 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5221  hypothetical protein  38.53 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.830501 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5513  hypothetical protein  38.53 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2152  hypothetical protein  28.04 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11948  hypothetical protein  27.52 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2306  hypothetical protein  25.3 
 
 
190 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4224  cyclase/dehydrase  25.45 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  32.04 
 
 
176 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  32.04 
 
 
176 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  31.07 
 
 
176 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  26.96 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1029  hypothetical protein  26.17 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.0601496 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1412  hypothetical protein  24.1 
 
 
190 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3198  hypothetical protein  24.1 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243896  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1327  hypothetical protein  24.1 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3071  hypothetical protein  24.1 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.368964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1040  hypothetical protein  24.1 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.103705  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2017  hypothetical protein  24.1 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>