More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00897 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  100 
 
 
884 aa  1828    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  30.94 
 
 
908 aa  427  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.9 
 
 
1013 aa  361  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 
1002 aa  340  8e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 
1002 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 
1002 aa  330  6e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.91 
 
 
745 aa  328  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  29.37 
 
 
745 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
745 aa  313  9e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
751 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
758 aa  303  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
758 aa  303  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  27.45 
 
 
762 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
769 aa  295  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 
775 aa  293  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
769 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  26.98 
 
 
1003 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
799 aa  290  8e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 
779 aa  287  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
938 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
775 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0383  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 
746 aa  286  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.269133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  27.73 
 
 
993 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
749 aa  284  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
835 aa  284  6.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 
774 aa  284  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.960478  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
762 aa  282  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
751 aa  278  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  26.05 
 
 
776 aa  276  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 
760 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
751 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
756 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
765 aa  270  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0099  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 
746 aa  270  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 
866 aa  270  8.999999999999999e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
791 aa  270  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
748 aa  268  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
760 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
760 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  27.45 
 
 
728 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 
1287 aa  263  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 
776 aa  262  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3185  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
762 aa  263  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97115  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
748 aa  260  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  39.62 
 
 
518 aa  260  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  26.87 
 
 
755 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
776 aa  257  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 
760 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 
743 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313016  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  35.26 
 
 
547 aa  253  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2910  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 
783 aa  252  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0200681  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0150  phytochrome sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 
752 aa  251  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 
869 aa  251  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  36.53 
 
 
742 aa  250  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 
730 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
930 aa  248  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  28.06 
 
 
842 aa  243  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
1223 aa  243  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
639 aa  238  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3820  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 
755 aa  236  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 
660 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  26.1 
 
 
846 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
816 aa  235  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
1261 aa  234  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
1222 aa  234  8.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
757 aa  233  8.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.43 
 
 
849 aa  232  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
1084 aa  232  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 
1185 aa  231  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  34.14 
 
 
1303 aa  230  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
1344 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  33.77 
 
 
659 aa  229  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
1406 aa  229  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
657 aa  228  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  36.26 
 
 
755 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  34.92 
 
 
554 aa  228  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1986  putative GAF sensor protein  28.82 
 
 
798 aa  227  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.932658  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  29.51 
 
 
844 aa  227  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  26.76 
 
 
783 aa  227  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  29.98 
 
 
760 aa  223  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5775  histidine kinase  33.9 
 
 
554 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.941039 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
776 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
775 aa  222  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
568 aa  222  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2377  ATP-binding region, ATPase-like  26.27 
 
 
759 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.974028  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
526 aa  221  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  32.02 
 
 
1015 aa  221  6e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
771 aa  221  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
1478 aa  220  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  31.35 
 
 
770 aa  220  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
529 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.75 
 
 
1535 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  33.33 
 
 
551 aa  219  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.44 
 
 
1152 aa  218  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  24.53 
 
 
855 aa  218  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
1297 aa  218  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
528 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
721 aa  217  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 
752 aa  217  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
955 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>