More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00755 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  100 
 
 		 296 aa  609  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  56.94 
 
 		 292 aa  345  7e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  51.54 
 
 		 292 aa  310  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  53.74 
 
 		 288 aa  299  4e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  51.72 
 
 		 291 aa  295  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  49.63 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  50 
 
 		 289 aa  279  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 287 aa  276  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  43.43 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  43.07 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  38.72 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  36.05 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  36.99 
 
 		 329 aa  186  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  32.13 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  34.35 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  35.54 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  34.32 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  30.57 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 313 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  31.13 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  30.17 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  29.8 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  27.94 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 		 209 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.1 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  28.29 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  27.65 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  27.89 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  25.41 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  23.21 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  27.13 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  27.2 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  29.78 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  26.04 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  26.97 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  23.91 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.47 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  26.09 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  26.04 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  26.04 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  23.8 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  23.4 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.38 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  27.6 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  25.86 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  27.15 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.64 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  26.12 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  24.2 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.14 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  31.55 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  26.7 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.13 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  28.95 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  34.23 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  26.02 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  26.1 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  26.07 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>