More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00664 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  100 
 
 		 305 aa  630  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  50.17 
 
 		 303 aa  299  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  50.99 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  50.99 
 
 		 311 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5121  homocysteine S-methyltransferase  49.83 
 
 		 299 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0135376  normal  0.478948 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  50 
 
 		 310 aa  290  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  49.34 
 
 		 300 aa  287  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  49.67 
 
 		 300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  48.67 
 
 		 310 aa  281  8.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  48.33 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  47.52 
 
 		 307 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  49.67 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  45.72 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  48.68 
 
 		 300 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1135  homocysteine S-methyltransferase family protein  48.15 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300332  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  45.7 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0975  homocysteine S-methyltransferase  48.04 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000866621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  48.34 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  46.69 
 
 		 309 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  46.6 
 
 		 313 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3747  homocysteine S-methyltransferase  48.01 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  46 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  43.79 
 
 		 302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  43.52 
 
 		 301 aa  242  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48307  predicted protein  39.57 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  36.09 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  37.5 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3928  homocysteine S-methyltransferase  37.54 
 
 		 308 aa  152  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.45742 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  34.2 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  28.38 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  28.39 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  27.5 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  30.74 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  29.39 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  27.41 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  27.94 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  26.4 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.97 
 
 		 605 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  26.69 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  30.56 
 
 		 325 aa  92.8  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  28.48 
 
 		 325 aa  92.8  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  27.99 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  27.56 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  27.24 
 
 		 807 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  26.06 
 
 		 804 aa  87  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  28.66 
 
 		 629 aa  85.9  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  26.07 
 
 		 800 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  28.94 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  23.49 
 
 		 1212 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  28.23 
 
 		 1232 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1670  homocysteine S-methyltransferase family protein  26.47 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4224  B12-dependent methionine synthase  26.52 
 
 		 1293 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0118  methionine synthase (B12-dependent)  27.41 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.85 
 
 		 346 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1406  homocysteine S-methyltransferase, putative  25.49 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  28.71 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  24.76 
 
 		 1224 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  25.45 
 
 		 1220 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  26.85 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  28.16 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  26.85 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.1 
 
 		 609 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  27.87 
 
 		 806 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1268  homocysteine S-methyltransferase  23.82 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.897971 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  26.62 
 
 		 839 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  25.32 
 
 		 1223 aa  75.5  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  25.69 
 
 		 1240 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  23.42 
 
 		 1176 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3739  B12-dependent methionine synthase  27.83 
 
 		 1252 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  26.44 
 
 		 1250 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  25.57 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  27.42 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  26.59 
 
 		 1263 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4088  B12-dependent methionine synthase  24.77 
 
 		 1251 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  27.3 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  25.32 
 
 		 1168 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  25.48 
 
 		 781 aa  75.1  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  23.62 
 
 		 780 aa  73.6  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  24.26 
 
 		 1230 aa  73.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  27.58 
 
 		 1238 aa  73.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  25.6 
 
 		 1226 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.62 
 
 		 617 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  26.11 
 
 		 1189 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  28.25 
 
 		 803 aa  73.2  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  26.65 
 
 		 1278 aa  72.8  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  26.96 
 
 		 1215 aa  72.4  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  24.52 
 
 		 1191 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.04 
 
 		 1163 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  25.3 
 
 		 1227 aa  72.4  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  28.15 
 
 		 818 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  26.69 
 
 		 1180 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  24.14 
 
 		 1156 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  23.64 
 
 		 774 aa  70.9  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  24.11 
 
 		 1244 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  24.25 
 
 		 1244 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  23.99 
 
 		 1188 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  27.6 
 
 		 1272 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0087  methionine synthase (B12-dependent)  25.45 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.398145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  25.08 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  24.37 
 
 		 1188 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>