More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00641 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 380 aa  789    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  86.93 
 
 		 355 aa  638    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  86.65 
 
 		 355 aa  644    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  85.8 
 
 		 355 aa  630  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  84.94 
 
 		 355 aa  631  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  85.23 
 
 		 355 aa  627  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  84.62 
 
 		 359 aa  626  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  83.71 
 
 		 354 aa  621  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  82.05 
 
 		 354 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  82.05 
 
 		 354 aa  616  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  82.05 
 
 		 354 aa  616  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  82.05 
 
 		 354 aa  616  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  81.77 
 
 		 354 aa  614  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  83.48 
 
 		 354 aa  615  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  81.77 
 
 		 355 aa  615  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  82.05 
 
 		 354 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  81.77 
 
 		 355 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  81.77 
 
 		 355 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  82.05 
 
 		 354 aa  616  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  82.05 
 
 		 354 aa  616  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  82.05 
 
 		 354 aa  616  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  82.29 
 
 		 354 aa  614  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  82.05 
 
 		 354 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  81.77 
 
 		 354 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  81.77 
 
 		 354 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  82.05 
 
 		 354 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  81.77 
 
 		 354 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  82.86 
 
 		 354 aa  605  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  82.86 
 
 		 354 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  80.63 
 
 		 357 aa  601  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  80.34 
 
 		 360 aa  596  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  78.06 
 
 		 354 aa  587  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  77.78 
 
 		 354 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  77.49 
 
 		 354 aa  580  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  77.49 
 
 		 354 aa  580  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  77.49 
 
 		 354 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  76.92 
 
 		 354 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  76.92 
 
 		 354 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  76.92 
 
 		 354 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  76.35 
 
 		 354 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  76.92 
 
 		 354 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  77.21 
 
 		 354 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  76.35 
 
 		 354 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  76.35 
 
 		 354 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  76.64 
 
 		 354 aa  569  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  76.35 
 
 		 354 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  76.07 
 
 		 354 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  75.5 
 
 		 354 aa  565  1e-160  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  74.43 
 
 		 354 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  74.15 
 
 		 354 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  74.43 
 
 		 354 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  74.15 
 
 		 354 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  73.5 
 
 		 354 aa  550  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  71.88 
 
 		 354 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  71.79 
 
 		 354 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  73.09 
 
 		 355 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  73.22 
 
 		 354 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  72.44 
 
 		 355 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  72.16 
 
 		 355 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  72.16 
 
 		 355 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  71.39 
 
 		 355 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  68 
 
 		 357 aa  518  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  69.77 
 
 		 351 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  70.94 
 
 		 354 aa  518  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  66.95 
 
 		 365 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1118  uroporphyrinogen decarboxylase  69.41 
 
 		 366 aa  513  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  68.57 
 
 		 353 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  67.25 
 
 		 352 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  67.81 
 
 		 365 aa  488  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  65.24 
 
 		 354 aa  481  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  64 
 
 		 364 aa  482  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  62.93 
 
 		 356 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  62.25 
 
 		 356 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  63.01 
 
 		 350 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  60.86 
 
 		 353 aa  455  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0705  uroporphyrinogen decarboxylase  60.4 
 
 		 365 aa  455  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  60.86 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  63.85 
 
 		 354 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  60.4 
 
 		 355 aa  448  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  63.85 
 
 		 354 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  56.65 
 
 		 392 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3292  uroporphyrinogen decarboxylase  58.81 
 
 		 392 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.136246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2944  uroporphyrinogen decarboxylase  58.81 
 
 		 392 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0032555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0134  uroporphyrinogen decarboxylase  57.97 
 
 		 372 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106114  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0111  uroporphyrinogen decarboxylase  58.81 
 
 		 392 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0979299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  58.24 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2962  uroporphyrinogen decarboxylase  56.1 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  58.24 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  56.1 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0110  uroporphyrinogen decarboxylase  58.07 
 
 		 375 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  58.24 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  58.52 
 
 		 364 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  58.24 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  58.24 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  58.24 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  58.07 
 
 		 392 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02179  uroporphyrinogen decarboxylase  60.91 
 
 		 354 aa  428  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3890  uroporphyrinogen decarboxylase  58.52 
 
 		 366 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0126  uroporphyrinogen decarboxylase  57.95 
 
 		 375 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3524  uroporphyrinogen decarboxylase  57.43 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>