44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00620 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00620  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 72 aa  150  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  49.32 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2428  hypothetical protein  45.21 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  45.21 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  43.06 
 
 		 85 aa  70.1  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  43.06 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  41.67 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  38.36 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  43.84 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  43.94 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  42.25 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  44.93 
 
 		 86 aa  62  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  43.06 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  44.12 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  49.12 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  34.25 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  47.46 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  40.28 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  40.79 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  38.16 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  42.42 
 
 		 89 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  41.33 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  39.47 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0747  hypothetical protein  44.78 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.144242  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1284  hypothetical protein  40.3 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1402  hypothetical protein  40.3 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  38.81 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  42.11 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  37.33 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  38.98 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0662  hypothetical protein  40.3 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  39.19 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  38.57 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  36 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  36 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  40.35 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1409  hypothetical protein  31.34 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.209175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0897  hypothetical protein  54.55 
 
 		 50 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  38.81 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  37.31 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  40.32 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0673  hypothetical protein  45.45 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0558  hypothetical protein  37.88 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00365448  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02920  hypothetical protein  34.43 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00324963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>