More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00481 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  68.9 
 
 		 564 aa  779    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  68.68 
 
 		 570 aa  781    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  71.69 
 
 		 545 aa  790    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  68.68 
 
 		 570 aa  782    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  100 
 
 		 563 aa  1157    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  68.27 
 
 		 573 aa  745    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  61.48 
 
 		 579 aa  667    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  68.51 
 
 		 570 aa  782    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  66.54 
 
 		 590 aa  727    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  68.86 
 
 		 563 aa  782    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  63.81 
 
 		 565 aa  697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  68.51 
 
 		 570 aa  782    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  70.46 
 
 		 570 aa  799    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  70.46 
 
 		 570 aa  800    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  69.63 
 
 		 570 aa  787    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  70.28 
 
 		 570 aa  799    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  69.03 
 
 		 568 aa  777    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  59.63 
 
 		 593 aa  660    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  51.53 
 
 		 565 aa  541  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  49.82 
 
 		 601 aa  512  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  46.02 
 
 		 512 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  43.64 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  45.32 
 
 		 533 aa  428  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  46.18 
 
 		 526 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  43.76 
 
 		 537 aa  425  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  44.11 
 
 		 525 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  45.57 
 
 		 533 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  44.61 
 
 		 536 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  44.2 
 
 		 538 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  46.96 
 
 		 542 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  45.02 
 
 		 539 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  43.65 
 
 		 530 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  43.65 
 
 		 538 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  43.57 
 
 		 534 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  43.3 
 
 		 536 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  45.3 
 
 		 538 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  43.12 
 
 		 534 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  44.17 
 
 		 543 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  44.4 
 
 		 568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  43.46 
 
 		 539 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  44.92 
 
 		 538 aa  405  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  41.79 
 
 		 529 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  42.14 
 
 		 534 aa  401  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  45.5 
 
 		 542 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  42.88 
 
 		 535 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  44.12 
 
 		 541 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  43.57 
 
 		 538 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  41.5 
 
 		 525 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  42.91 
 
 		 529 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  43.72 
 
 		 545 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  42.76 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  42.93 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  42.93 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  42.29 
 
 		 534 aa  388  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  42.93 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  42.76 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  42.76 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  42.76 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  43.25 
 
 		 549 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  42.26 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  42.4 
 
 		 634 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  42.88 
 
 		 545 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  45.66 
 
 		 531 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  40.86 
 
 		 529 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  42.62 
 
 		 537 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1499  gamma-glutamyltransferase 2  42.24 
 
 		 525 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  41.73 
 
 		 525 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  42.46 
 
 		 542 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  42.13 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0519  gamma-glutamyltransferase  43.7 
 
 		 532 aa  379  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2556  gamma-glutamyltransferase  41.73 
 
 		 525 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  42.65 
 
 		 542 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  41.73 
 
 		 525 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  42.05 
 
 		 545 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0149  gamma-glutamyltransferase  41.68 
 
 		 542 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  43.01 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  39.44 
 
 		 533 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  43.12 
 
 		 562 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  41.53 
 
 		 546 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  40.51 
 
 		 543 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  40.64 
 
 		 531 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  37.95 
 
 		 589 aa  364  3e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3878  gamma-glutamyltransferase 2  40.48 
 
 		 552 aa  362  7.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798637  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  37.91 
 
 		 539 aa  361  2e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  41.45 
 
 		 546 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  41.45 
 
 		 546 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  41.27 
 
 		 546 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  39.02 
 
 		 527 aa  360  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0071  gamma-glutamyltransferase  39.81 
 
 		 527 aa  359  6e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177118 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  37.08 
 
 		 528 aa  359  8e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  39.09 
 
 		 592 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  41.42 
 
 		 546 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  40.52 
 
 		 539 aa  357  5e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  43.04 
 
 		 531 aa  356  5e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  40.86 
 
 		 522 aa  355  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  41.06 
 
 		 546 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  40.74 
 
 		 531 aa  351  3e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  41.42 
 
 		 546 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  38.83 
 
 		 541 aa  347  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4079  gamma-glutamyltransferase  38.88 
 
 		 528 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>