More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00395 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00435  copper transporter  51.56 
 
 
834 aa  719    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  51.56 
 
 
834 aa  719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  45.03 
 
 
828 aa  637    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  46.3 
 
 
828 aa  645    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  49.26 
 
 
907 aa  716    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  52.16 
 
 
744 aa  718    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2072  copper-translocating P-type ATPase  53.99 
 
 
725 aa  729    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  49.53 
 
 
913 aa  721    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1689  cation transporter E1-E2 family ATPase  51.39 
 
 
753 aa  724    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  48.15 
 
 
826 aa  663    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0802  copper-transporting P-type ATPase  48.85 
 
 
902 aa  710    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  74.43 
 
 
782 aa  1147    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  47.56 
 
 
831 aa  656    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  100 
 
 
747 aa  1515    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  47.18 
 
 
827 aa  660    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  50.54 
 
 
797 aa  661    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  51.61 
 
 
833 aa  737    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1408  copper-translocating P-type ATPase  51.96 
 
 
744 aa  723    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.659936  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  54.78 
 
 
740 aa  829    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 
753 aa  663    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  47.71 
 
 
762 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2772  copper-translocating P-type ATPase  52.07 
 
 
757 aa  751    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  46.6 
 
 
834 aa  642    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  51.76 
 
 
834 aa  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
829 aa  639    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  51.42 
 
 
834 aa  720    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  48.53 
 
 
833 aa  671    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  48.51 
 
 
721 aa  654    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  46.9 
 
 
747 aa  674    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  48.71 
 
 
907 aa  718    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  51.01 
 
 
832 aa  745    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  47.57 
 
 
767 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  73.14 
 
 
747 aa  1077    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  47.57 
 
 
762 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  51.29 
 
 
834 aa  716    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  49.26 
 
 
841 aa  679    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  45.54 
 
 
828 aa  635    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  51.61 
 
 
833 aa  737    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  49.19 
 
 
961 aa  722    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  51.61 
 
 
833 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  51.56 
 
 
834 aa  719    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  48.14 
 
 
852 aa  679    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  47.86 
 
 
827 aa  656    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  51.15 
 
 
834 aa  712    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  49.19 
 
 
939 aa  717    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  49.07 
 
 
837 aa  669    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  54.93 
 
 
850 aa  793    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  48.21 
 
 
836 aa  680    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  48.92 
 
 
955 aa  716    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  46.98 
 
 
759 aa  671    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  51.48 
 
 
833 aa  737    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  47.81 
 
 
838 aa  657    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  46.94 
 
 
836 aa  657    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  47.14 
 
 
837 aa  653    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  48.94 
 
 
835 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  47.29 
 
 
841 aa  637    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  46.81 
 
 
836 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  47.71 
 
 
762 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  51.15 
 
 
834 aa  712    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  65.18 
 
 
750 aa  997    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  51.69 
 
 
834 aa  721    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  48.31 
 
 
855 aa  660    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  46.99 
 
 
750 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  46.98 
 
 
759 aa  671    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  47.51 
 
 
909 aa  704    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2587  copper-translocating P-type ATPase  52.56 
 
 
758 aa  746    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0901243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2654  copper-translocating P-type ATPase  52.43 
 
 
758 aa  749    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0212  copper-translocating P-type ATPase  70.75 
 
 
746 aa  1049    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  47.76 
 
 
915 aa  685    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1535  copper-translocating P-type ATPase  51.89 
 
 
744 aa  714    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.639562  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  55.22 
 
 
742 aa  838    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  47.71 
 
 
762 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  76.18 
 
 
778 aa  1149    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  47.46 
 
 
838 aa  638    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2761  copper-translocating P-type ATPase  52.32 
 
 
753 aa  748    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  46.88 
 
 
786 aa  670    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  47.51 
 
 
839 aa  645    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1485  copper-translocating P-type ATPase  50.33 
 
 
752 aa  702    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  70.11 
 
 
844 aa  1093    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  51.61 
 
 
833 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  47.13 
 
 
752 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  60.38 
 
 
860 aa  869    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1505  copper-translocating P-type ATPase  52.16 
 
 
744 aa  722    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  47.32 
 
 
840 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  46.81 
 
 
836 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  48.65 
 
 
833 aa  672    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3191  copper-translocating P-type ATPase  51.08 
 
 
760 aa  731    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.427707  normal  0.767066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2255  copper-translocating P-type ATPase  51.54 
 
 
869 aa  747    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  48.05 
 
 
898 aa  703    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  74.66 
 
 
748 aa  1113    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  49.32 
 
 
955 aa  726    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1499  copper-translocating P-type ATPase  52.29 
 
 
744 aa  719    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  47.6 
 
 
826 aa  653    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  45.09 
 
 
819 aa  632  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  46.66 
 
 
841 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  46.18 
 
 
758 aa  635  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  46.15 
 
 
839 aa  629  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  45.66 
 
 
827 aa  630  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  50.87 
 
 
724 aa  629  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  46.14 
 
 
818 aa  629  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>