More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00320 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



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Replicon accession
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Product
% identity
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  58.89 
 
 		 1047 aa  1271    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  58.99 
 
 		 1047 aa  1272    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  58.64 
 
 		 1045 aa  1256    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  47.7 
 
 		 1045 aa  990    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  57.74 
 
 		 1070 aa  1248    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2238  CzcA family heavy metal RND efflux protein  57.74 
 
 		 1070 aa  1248    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2246  CzcA family heavy metal efflux protein  46.21 
 
 		 1100 aa  952    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  59.33 
 
 		 1052 aa  1277    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  34.8 
 
 		 1070 aa  638    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2212  CzcA family heavy metal efflux protein  59.46 
 
 		 1049 aa  1301    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589008  normal  0.652924 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0282  CzcA family heavy metal efflux protein  58.83 
 
 		 1049 aa  1269    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  55.41 
 
 		 1066 aa  1179    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  60.8 
 
 		 1047 aa  1303    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.43 
 
 		 1049 aa  649    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  70.36 
 
 		 1042 aa  1509    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  34.91 
 
 		 1077 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  79.09 
 
 		 1052 aa  1679    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  34.91 
 
 		 1077 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  58.29 
 
 		 1045 aa  1246    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  59.32 
 
 		 1045 aa  1252    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0262  CzcA family heavy metal efflux protein  57.33 
 
 		 1048 aa  1253    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  57.74 
 
 		 1070 aa  1248    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  34.91 
 
 		 1077 aa  648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  50.05 
 
 		 1047 aa  1063    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  34.91 
 
 		 1049 aa  650    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4173  CzcA family heavy metal efflux protein  59.31 
 
 		 1049 aa  1275    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0319  CzcA family heavy metal RND efflux protein  57.74 
 
 		 1070 aa  1248    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  59.77 
 
 		 1068 aa  1266    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  58.64 
 
 		 1045 aa  1268    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  59.96 
 
 		 1068 aa  1281    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  55.98 
 
 		 1051 aa  1194    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  55.73 
 
 		 1044 aa  1173    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  54.78 
 
 		 1043 aa  1186    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  59.63 
 
 		 1039 aa  1292    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0061  RND family outer membrane copper/silver/drug transport protein  53.84 
 
 		 1069 aa  1144    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0332  CzcA family heavy metal RND efflux protein  57.74 
 
 		 1070 aa  1249    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.744474  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  59.62 
 
 		 1060 aa  1288    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1157  CzcA family heavy metal efflux protein  58.29 
 
 		 1038 aa  1263    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  55.44 
 
 		 1058 aa  1128    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  58.13 
 
 		 1070 aa  1244    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  34.77 
 
 		 1077 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0162  CzcA family heavy metal efflux protein  59.22 
 
 		 1049 aa  1272    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  59.43 
 
 		 1048 aa  1258    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2437  CzcA family heavy metal efflux protein  47.28 
 
 		 1091 aa  984    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  58.63 
 
 		 1067 aa  1253    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  48.29 
 
 		 1074 aa  1038    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  60.11 
 
 		 1056 aa  1308    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  35.09 
 
 		 1050 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  57.45 
 
 		 1074 aa  1256    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  34.8 
 
 		 1070 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  48.18 
 
 		 1045 aa  1021    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  57.33 
 
 		 1048 aa  1251    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0022  CzcA family heavy metal efflux protein  59.23 
 
 		 1052 aa  1291    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  58.14 
 
 		 1054 aa  1219    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4015  CzcA family heavy metal efflux protein  60.44 
 
 		 1050 aa  1315    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.310699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  35 
 
 		 1077 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  44.13 
 
 		 1015 aa  852    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1627  putative cation efflux system transmembrane protein  61.14 
 
 		 1063 aa  1324    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  52.47 
 
 		 1059 aa  1099    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  35 
 
 		 1077 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  35 
 
 		 1077 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  34.77 
 
 		 1077 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  48.07 
 
 		 1094 aa  1024    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  53.44 
 
 		 1051 aa  1109    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  56 
 
 		 1043 aa  1203    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  79.03 
 
 		 1039 aa  1699    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  46.26 
 
 		 1046 aa  936    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  57.07 
 
 		 1047 aa  1235    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  73.8 
 
 		 1042 aa  1553    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  54.18 
 
 		 1052 aa  1142    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  54.98 
 
 		 1059 aa  1178    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0089  CzcA family heavy metal efflux protein  46.99 
 
 		 1048 aa  999    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  57.74 
 
 		 1070 aa  1248    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594297  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  60.27 
 
 		 1056 aa  1304    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  34.11 
 
 		 1083 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  58.17 
 
 		 1045 aa  1261    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  57.84 
 
 		 1042 aa  1244    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3643  cation efflux system protein  54.35 
 
 		 1063 aa  1138    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  54.64 
 
 		 1043 aa  1129    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  64.75 
 
 		 1056 aa  1406    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  47.5 
 
 		 1045 aa  999    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  54.35 
 
 		 1060 aa  1120    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  55.75 
 
 		 1065 aa  1146    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0149  CzcA family heavy metal efflux protein  58.64 
 
 		 1049 aa  1269    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4513  CzcA family heavy metal efflux protein  61.04 
 
 		 1055 aa  1322    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  54.31 
 
 		 1060 aa  1126    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  77.96 
 
 		 1040 aa  1683    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  60.56 
 
 		 1056 aa  1308    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1232  CzcA family heavy metal efflux protein  58.45 
 
 		 1039 aa  1273    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.99301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3426  cation efflux system protein cusA  54.02 
 
 		 1057 aa  1148    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  60.61 
 
 		 1055 aa  1316    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  57.22 
 
 		 1044 aa  1222    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  58.77 
 
 		 1044 aa  1248    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  59.66 
 
 		 1047 aa  1288    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  34.8 
 
 		 1070 aa  638    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  59.77 
 
 		 1068 aa  1266    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3534  CzcA family heavy metal efflux protein  58.38 
 
 		 1047 aa  1258    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  71.99 
 
 		 1045 aa  1537    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  55.63 
 
 		 1058 aa  1152    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_3385  CzcA family heavy metal efflux protein  52.88 
 
 		 1061 aa  1124    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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