More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00258 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  100 
 
 		 163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  44.68 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  43.12 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  40.22 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  38.55 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  45.89 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  37.65 
 
 		 174 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  41.06 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  40.12 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  47.06 
 
 		 172 aa  97.8  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  36.42 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  46.02 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  44.23 
 
 		 166 aa  94.4  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  41.61 
 
 		 173 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  39.43 
 
 		 171 aa  94  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  49.54 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  44.93 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  57.5 
 
 		 176 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  43.41 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  47.01 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  51.16 
 
 		 166 aa  90.9  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  38.73 
 
 		 172 aa  90.9  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  37.14 
 
 		 173 aa  90.9  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  38.18 
 
 		 169 aa  90.5  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  38.07 
 
 		 172 aa  90.5  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3099  methylation site containing protein  35.62 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  46.09 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  42 
 
 		 178 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  45.22 
 
 		 169 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  36.05 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  61.54 
 
 		 187 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  45.54 
 
 		 205 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  45.54 
 
 		 205 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  45.54 
 
 		 205 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  45.54 
 
 		 205 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  48.42 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  38.99 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  40.65 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  39.87 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  44.44 
 
 		 205 aa  85.5  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  45.3 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  48.35 
 
 		 218 aa  85.5  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  31.48 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  42.37 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  48.89 
 
 		 202 aa  84  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  44.55 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  45.45 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  35.43 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  44.55 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  40.6 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  32.52 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  43.3 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  50.68 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  43.56 
 
 		 205 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  46.59 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  42.27 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  46.07 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  55.56 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1972  prepilin-type cleavage/methylation  38.46 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  57.14 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  39.22 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  38.35 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  39.45 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  51.39 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  49.21 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  46.84 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  46.84 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  36.8 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  49.21 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  32.93 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  46.84 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  37.61 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  53.33 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  46.84 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  44.19 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  45.24 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  30.86 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  38.78 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  48.05 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  38.78 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  37.76 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  30.27 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  37.76 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1388  methylation site containing protein  40.34 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  30.86 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  50.79 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  40.4 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  46.05 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  29.63 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  41.41 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0177  prepilin-type cleavage/methylation  54.44 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  41.41 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  36.84 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  53.7 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  42.7 
 
 		 229 aa  63.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  38.71 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  46.34 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  39.73 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  40.28 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4255  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  38.54 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>