More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00251 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  100 
 
 		 569 aa  1143    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0170  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  46.48 
 
 		 550 aa  481  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0454  MSHA biogenesis protein MshL  50.28 
 
 		 561 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3751  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  45.74 
 
 		 556 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  46.33 
 
 		 563 aa  457  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  45.07 
 
 		 609 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  44.93 
 
 		 567 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  43.43 
 
 		 562 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  45.1 
 
 		 556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  48.14 
 
 		 561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  47.95 
 
 		 561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  47.95 
 
 		 561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  48.41 
 
 		 558 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  47.26 
 
 		 559 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3835  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  47.07 
 
 		 559 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0508  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  47.07 
 
 		 559 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  47.26 
 
 		 559 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  48.24 
 
 		 560 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  44.61 
 
 		 549 aa  434  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  42.7 
 
 		 530 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03698  hypothetical protein  45.87 
 
 		 544 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  42.19 
 
 		 546 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  42.42 
 
 		 537 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  38.72 
 
 		 572 aa  351  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  50.28 
 
 		 559 aa  348  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  38.6 
 
 		 543 aa  338  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3332  type II and III secretion system protein  38.14 
 
 		 614 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.449777  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  35.47 
 
 		 538 aa  320  6e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0893  type II and III secretion system secretin  36 
 
 		 585 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  35.21 
 
 		 554 aa  306  8.000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  33.46 
 
 		 577 aa  289  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3405  type II and III secretion system protein  26.77 
 
 		 594 aa  167  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  27.31 
 
 		 581 aa  167  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  26.19 
 
 		 625 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  24.14 
 
 		 512 aa  156  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  25.75 
 
 		 563 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  24.82 
 
 		 539 aa  154  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  24.71 
 
 		 506 aa  151  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0109  type II and III secretion system protein  27.4 
 
 		 547 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.379094  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  27.65 
 
 		 508 aa  143  7e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0928  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  28.93 
 
 		 574 aa  141  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0351042  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0639  type II and III secretion system protein  26.33 
 
 		 569 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.2 
 
 		 830 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  22.67 
 
 		 470 aa  131  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  26.84 
 
 		 541 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  22.67 
 
 		 470 aa  130  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.78 
 
 		 506 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  27.72 
 
 		 546 aa  126  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  22.67 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  25.51 
 
 		 463 aa  123  9e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  28.27 
 
 		 819 aa  117  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  31.54 
 
 		 686 aa  116  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  29.63 
 
 		 740 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  30.34 
 
 		 686 aa  110  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  30.34 
 
 		 686 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  30.34 
 
 		 686 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  30.34 
 
 		 686 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  30.34 
 
 		 686 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  27.85 
 
 		 696 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  29.75 
 
 		 787 aa  107  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  26.28 
 
 		 672 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  28.1 
 
 		 675 aa  104  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  27.17 
 
 		 658 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  31.19 
 
 		 697 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  30.41 
 
 		 689 aa  103  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  30.28 
 
 		 641 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  26.96 
 
 		 810 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  27.38 
 
 		 714 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  28.11 
 
 		 660 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  30.38 
 
 		 793 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  27.46 
 
 		 655 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  27.8 
 
 		 797 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  27.78 
 
 		 670 aa  102  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  27.53 
 
 		 716 aa  102  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  27.89 
 
 		 805 aa  101  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  26.96 
 
 		 781 aa  100  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  30.4 
 
 		 915 aa  99  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  27.46 
 
 		 794 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  28.62 
 
 		 783 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  30.22 
 
 		 829 aa  97.8  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  29.39 
 
 		 704 aa  98.2  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  26.65 
 
 		 781 aa  97.8  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  30.61 
 
 		 662 aa  97.4  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  29.07 
 
 		 736 aa  97.1  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  27.1 
 
 		 712 aa  97.1  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  27.24 
 
 		 635 aa  96.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  28.66 
 
 		 658 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  28.04 
 
 		 738 aa  96.3  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  27.73 
 
 		 729 aa  95.5  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  28.34 
 
 		 793 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  26.43 
 
 		 377 aa  95.5  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  28 
 
 		 717 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4402  type II and III secretion system protein  27 
 
 		 622 aa  95.1  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  28.62 
 
 		 702 aa  95.5  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  28.71 
 
 		 804 aa  94.7  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  29.93 
 
 		 807 aa  94.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  29.39 
 
 		 703 aa  94.7  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1043  type II and III secretion system protein  25.88 
 
 		 589 aa  94.7  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0150789  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  28.19 
 
 		 658 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  28.1 
 
 		 640 aa  93.6  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>