281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00239 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  51.67 
 
 		 785 aa  782    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  58.91 
 
 		 781 aa  903    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  58.64 
 
 		 781 aa  897    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  100 
 
 		 763 aa  1585    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  39.27 
 
 		 766 aa  510  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.52 
 
 		 913 aa  328  2.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  28.53 
 
 		 743 aa  288  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  27.28 
 
 		 750 aa  279  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  27.59 
 
 		 862 aa  227  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.42 
 
 		 741 aa  220  8.999999999999998e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.88 
 
 		 858 aa  201  6e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  24.53 
 
 		 827 aa  198  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  27.16 
 
 		 928 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  25.99 
 
 		 804 aa  191  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  26.14 
 
 		 804 aa  191  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.03 
 
 		 747 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  30.96 
 
 		 979 aa  188  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  26.09 
 
 		 815 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  25.97 
 
 		 1015 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.42 
 
 		 748 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.49 
 
 		 787 aa  181  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 		 803 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  28.78 
 
 		 894 aa  178  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.28 
 
 		 811 aa  177  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  23.9 
 
 		 754 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  29.31 
 
 		 806 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.61 
 
 		 986 aa  166  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  24.41 
 
 		 824 aa  165  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  28.74 
 
 		 859 aa  165  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.81 
 
 		 922 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  27.42 
 
 		 848 aa  164  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  24.89 
 
 		 897 aa  161  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 		 925 aa  161  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 807 aa  160  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  27.23 
 
 		 858 aa  158  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.62 
 
 		 805 aa  157  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  28.07 
 
 		 806 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  31.74 
 
 		 972 aa  153  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 		 888 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.4 
 
 		 805 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  25.66 
 
 		 717 aa  150  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  22.76 
 
 		 984 aa  150  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  27.61 
 
 		 1355 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  27.38 
 
 		 1108 aa  148  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.64 
 
 		 813 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  23.16 
 
 		 961 aa  146  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.49 
 
 		 794 aa  147  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 		 829 aa  145  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 		 919 aa  144  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  24.39 
 
 		 707 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  26.36 
 
 		 1019 aa  143  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  29.23 
 
 		 873 aa  142  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.21 
 
 		 903 aa  142  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  24.46 
 
 		 832 aa  140  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  24.25 
 
 		 1171 aa  140  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  23.82 
 
 		 932 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  26.15 
 
 		 601 aa  137  9e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  28.19 
 
 		 600 aa  137  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  29.16 
 
 		 1079 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  23.24 
 
 		 1185 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  30.03 
 
 		 1063 aa  134  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.91 
 
 		 824 aa  134  6.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  30.73 
 
 		 587 aa  134  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  26.6 
 
 		 825 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  28.65 
 
 		 625 aa  132  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  27.59 
 
 		 607 aa  131  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.42 
 
 		 1781 aa  131  4.0000000000000003e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  28.05 
 
 		 951 aa  131  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.48 
 
 		 920 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  24.27 
 
 		 704 aa  131  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  24.07 
 
 		 964 aa  130  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  28.12 
 
 		 1129 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  29.97 
 
 		 738 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  27.92 
 
 		 603 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.77 
 
 		 1033 aa  127  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  29.12 
 
 		 799 aa  127  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 		 808 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  28.07 
 
 		 670 aa  125  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.88 
 
 		 1093 aa  124  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  30.19 
 
 		 604 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  26.53 
 
 		 891 aa  122  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 		 1094 aa  122  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  25.6 
 
 		 603 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  25.36 
 
 		 603 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  27.16 
 
 		 564 aa  121  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  26.45 
 
 		 563 aa  121  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  25.6 
 
 		 603 aa  121  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 		 598 aa  120  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.79 
 
 		 1289 aa  120  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  25.36 
 
 		 603 aa  120  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  25.36 
 
 		 603 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  25.7 
 
 		 577 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  25.36 
 
 		 603 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  29.18 
 
 		 1024 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.47 
 
 		 1018 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.56 
 
 		 1264 aa  118  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  25 
 
 		 677 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  27.76 
 
 		 686 aa  117  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  27.58 
 
 		 1050 aa  117  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  27.58 
 
 		 1066 aa  117  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>