277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00088 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00088  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  100 
 
 
557 aa  1154    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3588  hypothetical protein  63.38 
 
 
558 aa  718    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0889  hypothetical protein  59.57 
 
 
554 aa  681    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2303  hypothetical protein  57.14 
 
 
1496 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5044  hypothetical protein  58.7 
 
 
555 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1762  hypothetical protein  57.66 
 
 
556 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1667  hypothetical protein  58.27 
 
 
559 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358711  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2281  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.32 
 
 
556 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.547695  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2173  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  57.14 
 
 
556 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1813  hypothetical protein  60.29 
 
 
554 aa  672    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0674  hypothetical protein  58.88 
 
 
551 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0947  hypothetical protein  60.18 
 
 
554 aa  681    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2117  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  57.14 
 
 
556 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2373  hypothetical protein  62.43 
 
 
556 aa  691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000294292  hitchhiker  0.0000289236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4148  protein of unknown function DUF442  57.4 
 
 
557 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6333  hypothetical protein  58.21 
 
 
556 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3839  hypothetical protein  58 
 
 
567 aa  642    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.359472  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1670  hypothetical protein  58.09 
 
 
559 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1746  hypothetical protein  58.21 
 
 
556 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529191  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6238  hypothetical protein  59.24 
 
 
556 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0868  hypothetical protein  54.87 
 
 
539 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.210326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1514  hypothetical protein  54.99 
 
 
555 aa  588  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18624  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0053  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.47 
 
 
422 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000634616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0072  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.97 
 
 
423 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245934  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0069  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.47 
 
 
422 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0106574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0069  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.47 
 
 
422 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000464578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0079  hypothetical protein  59.95 
 
 
417 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5350  hypothetical protein  63.2 
 
 
396 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.723811  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0109  hypothetical protein  59.35 
 
 
417 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0378  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.77 
 
 
421 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1682  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase class-II  58.14 
 
 
427 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3458  hypothetical protein  54.55 
 
 
414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0799  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.88 
 
 
413 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2918  hypothetical protein  57.92 
 
 
411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1542  putative transmembrane protein  55.44 
 
 
421 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0588394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34330  hypothetical protein  57.14 
 
 
411 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00153013  normal  0.203445 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1939  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.73 
 
 
425 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.746538  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.27 
 
 
418 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2006  putative oxidoreductase  47.9 
 
 
418 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113232  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2576  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.65 
 
 
404 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581088  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.96 
 
 
401 aa  369  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0045  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.36 
 
 
396 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2352  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.8 
 
 
395 aa  359  7e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.128946  normal  0.129463 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2848  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.58 
 
 
422 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.815625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.6 
 
 
400 aa  354  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438506  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1831  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.6 
 
 
400 aa  355  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.436589 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3630  sulfide quinone oxidoreductase-like protein  45.09 
 
 
421 aa  349  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.217473  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2915  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.65 
 
 
399 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1961  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.61 
 
 
401 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209751  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5690  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.59 
 
 
399 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.59 
 
 
399 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.59 
 
 
399 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0986  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.59 
 
 
398 aa  343  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0075  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.92 
 
 
397 aa  338  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.92 
 
 
397 aa  338  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3758  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.58 
 
 
426 aa  333  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.379311 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3633  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.92 
 
 
396 aa  332  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.315982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2891  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.96 
 
 
401 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.42 
 
 
395 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0708248  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2712  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.04 
 
 
400 aa  324  3e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.862127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3958  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase-like protein  43.43 
 
 
372 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.203323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3237  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.75 
 
 
400 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3524  hypothetical protein  37.28 
 
 
399 aa  293  8e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01825  conserved hypothetical protein  38.06 
 
 
487 aa  292  9e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.75293 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08346  conserved hypothetical protein  39.33 
 
 
442 aa  291  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2551  hypothetical protein  37.75 
 
 
399 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.30285e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2276  hypothetical protein  37.5 
 
 
399 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1731  hypothetical protein  37.75 
 
 
399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000598467 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2360  hypothetical protein  37.75 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.204751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2537  hypothetical protein  37.75 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0495125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2337  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.78 
 
 
399 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135396  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3042  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.91 
 
 
398 aa  282  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03140  Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial precursor, putative  40.68 
 
 
458 aa  265  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2082  twin-arginine translocation pathway signal  32.89 
 
 
491 aa  241  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2318  hypothetical protein  37.61 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000211189  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.58 
 
 
456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169709  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1298  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.49 
 
 
489 aa  231  3e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.53579  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1665  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.85 
 
 
461 aa  216  8e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2307  twin-arginine translocation pathway signal  32.1 
 
 
451 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00993475  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.13 
 
 
449 aa  207  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.809961  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20580  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  30.33 
 
 
401 aa  206  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal  0.761376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3497  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.15 
 
 
396 aa  205  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1051  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.75 
 
 
390 aa  201  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1034  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.25 
 
 
394 aa  200  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2526  putative sulfide quinone-rductase  32.35 
 
 
433 aa  200  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.149353 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4021  hypothetical protein  31.28 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.79 
 
 
438 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0355  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.86 
 
 
403 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198305  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0365  sulfide-quinone reductase  28.86 
 
 
403 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0344  sulfide-quinone reductase  28.61 
 
 
403 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0928  twin-arginine translocation pathway signal  29.24 
 
 
436 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0624  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.04 
 
 
413 aa  147  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0441404 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0223  oxidoreductase, putative  25.98 
 
 
413 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1203  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.23 
 
 
413 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.223151  normal  0.0279723 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1846  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.1 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0069  sulfide dehydrogenase, flavoprotein subunit, putative  25.85 
 
 
408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0350  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.82 
 
 
411 aa  124  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1495  hypothetical protein  40.74 
 
 
142 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1554  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.03 
 
 
408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.138705 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0165  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.22 
 
 
379 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.934981  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>