33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00051 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00051  putative lipoprotein  100 
 
 
229 aa  475  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0750623  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3202  hypothetical protein  32.88 
 
 
224 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.210249  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1322  putative lipoprotein  28.22 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00089684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3012  putative lipoprotein  28.5 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000028974  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2845  putative lipoprotein  25.82 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2329  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  22.9 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2610  putative regulator  22.9 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.283606 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1102  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  22.9 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1096  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  22.9 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2657  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  22.9 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112899  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00996  hypothetical protein  22.9 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00989  predicted outer membrane lipoprotein  22.9 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1222  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  22.9 
 
 
214 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000233631  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1395  putative lipoprotein  25.21 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.19041  normal  0.0366327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1407  putative lipoprotein  25.11 
 
 
236 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3157  putative lipoprotein  23.79 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1342  putative lipoprotein  25.11 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2861  putative lipoprotein  22.69 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000231875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2521  putative lipoprotein  23.25 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3007  putative lipoprotein  23.53 
 
 
235 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000100687  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3832  hypothetical protein  26.29 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.573259  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001789  hypothetical protein  25.99 
 
 
226 aa  42.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4575  hypothetical protein  30.28 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4266  hypothetical protein  30.28 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4488  hypothetical protein  29.91 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4003  hypothetical protein  29.91 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.401316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03859  hypothetical protein  29.91 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3970  conserved hypothetical protein  29.91 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03899  predicted lipoprotein  29.91 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5506  hypothetical protein  29.91 
 
 
212 aa  42  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1498  lipoprotein, putative  21.52 
 
 
235 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000176994  normal  0.35232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2878  putative lipoprotein  21.52 
 
 
235 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000189272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0232  lipoprotein  29.73 
 
 
212 aa  41.6  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.231954  normal  0.698414 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>