298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_R0024 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_R0050  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0024  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.574829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0011  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000477421 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0052  tRNA-Glu  98.48 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0006  tRNA-Glu  98.48 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0055  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0004  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0012  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.12218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0053  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0030  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0242042  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0029  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  hitchhiker  0.000705455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0032  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00151707  hitchhiker  0.000680514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0094  tRNA-Glu  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.115481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0023  tRNA-Glu  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707978  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0084  tRNA-Glu  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0034  tRNA-Glu  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0070  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal  0.130321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0030  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.437879  normal  0.359781 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0002  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12539  normal  0.0346433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0022  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0391  tRNA-Glu  92.19 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0034  tRNA-Glu  92.06 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0031  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0217674  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0042  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336501  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1672  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0027  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0009  tRNA-Glu  89.04 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.488573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0066  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000193579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0018  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.141914 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0057  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0731133  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t24  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t25  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0571109  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1242  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0541834  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0745  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105433  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2336  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0131684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0041  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1998  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0052  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.514953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t31  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.281788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t33  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t38  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444842  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t40  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.1195  normal  0.0190117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t42  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0670416  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60540  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.454942  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34010  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284833  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1796  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0030  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0052  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0034  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t20  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t22  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t30  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t32  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA37  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA39  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783995  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA58  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.237213  normal  0.68605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA60  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.095942  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R33  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R35  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R62  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R64  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R66  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0043  tRNA-Glu  89.39 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60120  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0048  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0051  tRNA-Glu  89.39 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0050  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0032  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0707402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0019  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60520  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.671804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23580  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0268964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27600  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0544848  hitchhiker  0.00250338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0050  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.652046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0072  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0070  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.924064  normal  0.541649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0081  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.863726  normal  0.5241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0079  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.672863  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0074  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.562141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1996  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0047  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877641  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0028  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0423864  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0030  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.044277  normal  0.615022 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2134  tRNA-Glu  89.39 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00397523  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0050  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0046  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0048  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0025  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.797735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0023  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0043  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888454 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0021  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0389  tRNA-Glu  86.3 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0245226  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  95 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  95 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0077  tRNA-Glu  95 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0030  tRNA-Glu  95 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403372  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2209  tRNA-Glu  90 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.35059  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0003  tRNA-Glu  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0007  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866877  hitchhiker  0.000537745 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0001  tRNA-Glu  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1710  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>