117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_7008 on replicon NC_010373
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010373  M446_7008  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5660  hypothetical protein  34.65 
 
 		 325 aa  185  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  35.56 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  34.64 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6747  hypothetical protein  30.6 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5656  hypothetical protein  30.4 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  33.53 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  33.87 
 
 		 354 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  33.03 
 
 		 329 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  34.23 
 
 		 365 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1048  hypothetical protein  36.96 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5292  hypothetical protein  32.83 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.562532  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6911  hypothetical protein  30.28 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1481  hypothetical protein  31.75 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0039  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  31.67 
 
 		 327 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2818  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  34.25 
 
 		 326 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  25.56 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  26.23 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2904  hypothetical protein  31.52 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  25.93 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  23.38 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  29.2 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  29.96 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  27.4 
 
 		 322 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  28.47 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  24.92 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.74 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  27.72 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.74 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  27.74 
 
 		 317 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  24.62 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  23.61 
 
 		 341 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.72 
 
 		 327 aa  93.2  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  25.1 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  24.7 
 
 		 325 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  27.59 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  22.19 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4781  protein of unknown function DUF534  24.68 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  25.33 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  28.63 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  23.31 
 
 		 328 aa  86.3  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  23.36 
 
 		 584 aa  85.5  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  25.86 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  23.51 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  23.89 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  21.81 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  25.63 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  24.4 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  25.1 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  23.89 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  23.29 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  23.69 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.59 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  23.59 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.59 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.59 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.59 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.59 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.59 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  20.97 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  23.62 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  23.1 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  21.18 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  22.8 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  21.4 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  21.4 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  23.6 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  19.55 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  23.43 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.62 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  22.46 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  23.66 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  23.89 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  23.48 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  23.48 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  23.89 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  23.48 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  23.73 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  26.51 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  25 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  23.96 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  27.31 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  25.1 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  25.76 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  26.33 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  20.48 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  25.93 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  24.02 
 
 		 270 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  25.31 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  26.9 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  26.29 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  24.69 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  26.72 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  25.88 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  26.62 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  22.98 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.43 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  24.92 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  21.15 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  20.9 
 
 		 640 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>