20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6918 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6918  hypothetical protein  100 
 
 
681 aa  1391    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2898  hypothetical protein  44.37 
 
 
825 aa  357  3.9999999999999996e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.523858  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  38.81 
 
 
751 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0602  hypothetical protein  37.24 
 
 
493 aa  230  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2235  hypothetical protein  32.04 
 
 
526 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.215413  n/a   
 
 
-
 
NC_011890  Mnod_7767  hypothetical protein  34.26 
 
 
846 aa  173  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  26.89 
 
 
756 aa  94  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18136  predicted protein  23.89 
 
 
724 aa  79.7  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0028227  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27548  predicted protein  24.23 
 
 
689 aa  79.3  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000091689  normal  0.509661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  44.57 
 
 
719 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  29.28 
 
 
833 aa  72  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1907  hypothetical protein  27.62 
 
 
485 aa  70.1  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.27137  hitchhiker  0.000000104796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1984  virulence-associated E family protein  52.78 
 
 
509 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1191  bifunctional DNA primase/polymerase  25.2 
 
 
920 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0184938  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  26.12 
 
 
820 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0325  hypothetical protein  32.63 
 
 
188 aa  61.2  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.606726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  43.53 
 
 
970 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0468  hypothetical protein  24.62 
 
 
566 aa  59.3  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.27 
 
 
970 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3313  hypothetical protein  21.8 
 
 
444 aa  56.2  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>