36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6853 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6853  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3155  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  75.34 
 
 		 218 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0050  hypothetical protein  73.06 
 
 		 219 aa  300  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.390549  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0028  hypothetical protein  76.26 
 
 		 218 aa  286  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0029  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  76.26 
 
 		 219 aa  276  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0520843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0171  hypothetical protein  59.62 
 
 		 219 aa  228  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.846138 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2046  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  45.64 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0792  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  48.48 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1273  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  48.48 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1245  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  48.17 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0753275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4416  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.86 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3188  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  43.17 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.605974 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1151  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.62 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1163  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.1 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.707422  normal  0.167545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0790  malonate decarboxylase  41.71 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00220342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1260  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  43.45 
 
 		 296 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0610  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  43.45 
 
 		 296 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0543  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  43.45 
 
 		 308 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39768  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3033  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  43.45 
 
 		 308 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1456  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  43.88 
 
 		 308 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0184396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1486  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  43.45 
 
 		 308 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2799  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  45.32 
 
 		 294 aa  96.7  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0976082  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1587  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  43.88 
 
 		 307 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4290  hypothetical protein  38.43 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5370  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  34.27 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0548916  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1077  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  35.98 
 
 		 213 aa  85.5  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1764  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  32.87 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0075  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  32.14 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1847  malonate decarboxylase  31.9 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.705884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4016  malonate decarboxylase  30.32 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3293  hypothetical protein  32.43 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2892  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  52.24 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1062  hypothetical protein  31.62 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2496  hypothetical protein  23.87 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1327  hypothetical protein  31.37 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1142  putative malonate decarboxylase, subunit E  23.79 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0172841  normal  0.360178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>