More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6836 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7574  threonine dehydratase  90.51 
 
 		 415 aa  675    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6836  threonine dehydratase  100 
 
 		 413 aa  805    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  54.94 
 
 		 403 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  52.38 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4294  threonine dehydratase  57.54 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  55.22 
 
 		 412 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  51.54 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2877  threonine dehydratase  56.3 
 
 		 422 aa  354  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188993  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  50.39 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  53.12 
 
 		 402 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  53.2 
 
 		 399 aa  346  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  53.2 
 
 		 399 aa  346  5e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  50.63 
 
 		 415 aa  344  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  50.12 
 
 		 409 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  50.91 
 
 		 415 aa  341  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  53.09 
 
 		 416 aa  341  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  50.13 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  50.9 
 
 		 415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  47.77 
 
 		 412 aa  334  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  49.49 
 
 		 421 aa  324  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  51.81 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  50.63 
 
 		 415 aa  322  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1146  threonine dehydratase  50.66 
 
 		 423 aa  315  7e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0807272  normal  0.0946601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  42.57 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  44.11 
 
 		 403 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  44.8 
 
 		 403 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  38.75 
 
 		 403 aa  286  4e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  39.28 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  44.11 
 
 		 403 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  43.86 
 
 		 403 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  38.13 
 
 		 403 aa  279  6e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 403 aa  277  3e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  37.63 
 
 		 403 aa  275  9e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  43.18 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  44.84 
 
 		 413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  37.37 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  40.61 
 
 		 402 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  43.86 
 
 		 401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  43.86 
 
 		 401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  39.19 
 
 		 395 aa  269  5.9999999999999995e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  40.71 
 
 		 400 aa  268  8.999999999999999e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  38.89 
 
 		 401 aa  265  8.999999999999999e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  41.18 
 
 		 403 aa  265  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  36.5 
 
 		 403 aa  260  4e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  38.97 
 
 		 537 aa  258  1e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  38.54 
 
 		 401 aa  257  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  35.22 
 
 		 402 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  36.62 
 
 		 404 aa  256  7e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  41.76 
 
 		 418 aa  253  3e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  43.25 
 
 		 416 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  35.22 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  43.08 
 
 		 415 aa  249  8e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  39.29 
 
 		 402 aa  246  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  43.14 
 
 		 410 aa  246  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31740  predicted protein  39.44 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.414163 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  40.86 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  40.86 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  39.7 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  41.81 
 
 		 403 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  41.18 
 
 		 402 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  43 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  43.18 
 
 		 404 aa  239  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  38.5 
 
 		 408 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19518  predicted protein  40.05 
 
 		 479 aa  237  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  41.28 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  41.12 
 
 		 404 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  37.5 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  38.71 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  41.9 
 
 		 406 aa  236  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  42.61 
 
 		 410 aa  233  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  42.24 
 
 		 412 aa  232  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  39.65 
 
 		 402 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  39.63 
 
 		 411 aa  231  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  39.9 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08200  L-threonine ammonia-lyase  40.61 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0196535 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  41.34 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  43.95 
 
 		 320 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  36.76 
 
 		 402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  34.89 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  41.42 
 
 		 404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  38.12 
 
 		 514 aa  225  9e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  41.44 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  39.35 
 
 		 412 aa  222  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  42.53 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  40.82 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  35.14 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  40.95 
 
 		 406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  40.86 
 
 		 402 aa  219  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  41.5 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  42.01 
 
 		 402 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  41.41 
 
 		 401 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  40.9 
 
 		 504 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  40.9 
 
 		 504 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  42 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  38.83 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  35.66 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  40.81 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  36.19 
 
 		 511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>