214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6742 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6742  MucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  288  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1890  MucR family transcriptional regulator  90.91 
 
 		 143 aa  266  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  84.44 
 
 		 143 aa  239  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  72.73 
 
 		 133 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 133 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  71.21 
 
 		 145 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6541  transcriptional regulator, MucR family  68.31 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  71.43 
 
 		 166 aa  191  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  71.54 
 
 		 133 aa  189  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  71.9 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3684  transcriptional regulator, MucR family  68.75 
 
 		 162 aa  184  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  68.5 
 
 		 160 aa  184  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  70.4 
 
 		 173 aa  184  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4116  MucR family transcriptional regulator  74.29 
 
 		 140 aa  183  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  68.5 
 
 		 171 aa  183  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  68 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  66.93 
 
 		 160 aa  178  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  68.6 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  66.93 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4253  transcriptional regulator, MucR family  63.57 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2620  transcriptional regulator, MucR family  64.96 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  67.77 
 
 		 164 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  68 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5488  MucR family transcriptional regulator  67.77 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622801  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5073  transcriptional regulator, MucR family  68.85 
 
 		 139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2484  transcriptional regulator, MucR family  65.15 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0549  transcriptional regulator, MucR family  62.5 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973698  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  64.93 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  67.77 
 
 		 166 aa  168  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  64.52 
 
 		 144 aa  168  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4087  transcriptional regulator, MucR family  63.5 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6298  MucR family transcriptional regulator  69.6 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  68.07 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3559  transcriptional regulator, MucR family  69.49 
 
 		 144 aa  166  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  63.28 
 
 		 163 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  63.85 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  63.85 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5626  transcriptional regulator, MucR family  67.69 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.63695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  61.6 
 
 		 164 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4944  MucR family transcriptional regulator  66.15 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3504  transcriptional regulator, MucR family  66.94 
 
 		 131 aa  158  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0608  MucR family transcriptional regulator  68.25 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0460505 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8789  transcriptional regulator, MucR family  60.94 
 
 		 147 aa  156  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292559  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  61.72 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  57.97 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  57.97 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  60.32 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  57.14 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  56.52 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7826  transcriptional regulator, MucR family  54.93 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  58.99 
 
 		 174 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2100  transcriptional regulator, MucR family  61.76 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4157  transcriptional regulator, MucR family  57.69 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4097  MucR family transcriptional regulator  61.79 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  58.27 
 
 		 171 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0124  transcriptional regulator, MucR family  52.99 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3505  transcriptional regulator, MucR family  57.46 
 
 		 174 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8753  transcriptional regulator, MucR family  59.23 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  57.48 
 
 		 168 aa  147  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5627  transcriptional regulator, MucR family  57.46 
 
 		 174 aa  147  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.698408  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6371  MucR family transcriptional regulator  57.6 
 
 		 137 aa  146  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 174 aa  146  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2365  transcriptional regulator, MucR family  57.36 
 
 		 176 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  56.15 
 
 		 137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4669  MucR family transcriptional regulator  55.47 
 
 		 169 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8109  transcriptional regulator, MucR family  55 
 
 		 173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0075  MucR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3902  transcriptional regulator, MucR family  56.59 
 
 		 172 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  55.22 
 
 		 175 aa  144  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  55.22 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6343  transcriptional regulator, MucR family  56.82 
 
 		 189 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0587  MucR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0109398  hitchhiker  0.00472777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4938  transcriptional regulator, MucR family  50.36 
 
 		 176 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686756  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4474  ROSMUCR transcriptional regulator  50.36 
 
 		 176 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4988  transcriptional regulator, MucR family  54.69 
 
 		 177 aa  143  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103901  normal  0.173335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0068  transcriptional regulator, MucR family  57.03 
 
 		 174 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  56 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1357  MucR family transcriptional regulator  55.3 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.067604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1774  MucR family transcriptional regulator  56.59 
 
 		 138 aa  139  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257701  normal  0.0107118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  54.4 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5564  MucR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  54.33 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4896  MucR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 180 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127609  hitchhiker  0.00352911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6743  MucR family transcriptional regulator  56.39 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328928  normal  0.300512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4977  transcriptional regulator, MucR family  52.99 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4660  transcriptional regulator, MucR family  57.48 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20016  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  55.91 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  55.91 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1889  MucR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8284  transcriptional regulator, MucR family  55.91 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647815  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  52.85 
 
 		 168 aa  135  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>