More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6621 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6621  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 		 493 aa  965    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647751  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2581  Uracil-DNA glycosylase superfamily  70.23 
 
 		 485 aa  639    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148154  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  70.02 
 
 		 485 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  70.67 
 
 		 493 aa  664    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2263  Uracil-DNA glycosylase superfamily  71.25 
 
 		 485 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.27 
 
 		 476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.28 
 
 		 495 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.15 
 
 		 480 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.66 
 
 		 484 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.46 
 
 		 484 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  46 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  44.51 
 
 		 492 aa  355  7.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2039  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.29 
 
 		 476 aa  351  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03048  uracil DNA glycosylase superfamily protein  48.46 
 
 		 477 aa  350  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2232  putative uracil-DNA glycosylase  46.15 
 
 		 474 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0908  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.35 
 
 		 485 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.88 
 
 		 485 aa  340  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4607  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.74 
 
 		 479 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2068  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.87 
 
 		 465 aa  333  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.803704  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.41 
 
 		 491 aa  263  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1310  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.06 
 
 		 490 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1758  uracil-DNA glycosylase  45.07 
 
 		 299 aa  221  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3194  Uracil-DNA glycosylase superfamily  34.51 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4595  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.12 
 
 		 300 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5910  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.85 
 
 		 220 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2840  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.67 
 
 		 206 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182688  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2228  hypothetical protein  32.5 
 
 		 507 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.77 
 
 		 225 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237053  normal  0.0854342 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.75 
 
 		 213 aa  183  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.669863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4407  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.75 
 
 		 213 aa  183  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.380012 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1286  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.33 
 
 		 209 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3354  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.56 
 
 		 217 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3585  putative DNA polymerase related protein  34.67 
 
 		 264 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01932  putative DNA polymerase related protein  35.4 
 
 		 265 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2572  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  57.3 
 
 		 260 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  0.578981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4850  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.94 
 
 		 279 aa  176  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0473991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3335  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.23 
 
 		 211 aa  175  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0920628 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.39 
 
 		 213 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.52 
 
 		 247 aa  172  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.166552  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4052  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.65 
 
 		 202 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.833859  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2690  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.55 
 
 		 224 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.24 
 
 		 223 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0522  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.91 
 
 		 208 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078684 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4300  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.26 
 
 		 207 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5462  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.42 
 
 		 219 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.07 
 
 		 223 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.07 
 
 		 223 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3202  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.89 
 
 		 217 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961371 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.22 
 
 		 217 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3037  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.65 
 
 		 230 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3144  uracil-DNA glycosylase  51.96 
 
 		 218 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2993  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.65 
 
 		 230 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5631  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.01 
 
 		 217 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609757  normal  0.0369434 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3015  uracil-DNA glycosylase  51.96 
 
 		 218 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3008  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.1 
 
 		 229 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780326 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0834  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.65 
 
 		 223 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597478  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2785  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.6 
 
 		 224 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2808  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.13 
 
 		 237 aa  157  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1364  putative DNA glycosylase  51.96 
 
 		 218 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.77623  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5994  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.87 
 
 		 546 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263417 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0118  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.96 
 
 		 217 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5408  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.56 
 
 		 244 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.937407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.12 
 
 		 216 aa  147  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1521  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.96 
 
 		 229 aa  146  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1181  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.56 
 
 		 224 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4396  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.37 
 
 		 207 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12930  uracil-DNA glycosylase, family 4  47.51 
 
 		 211 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0404  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.61 
 
 		 214 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112864  normal  0.964796 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1481  putative phage DNA polymerase  43.28 
 
 		 235 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4147  hypothetical protein  40.36 
 
 		 295 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3468  hypothetical protein  33.2 
 
 		 279 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2624  hypothetical protein  32.32 
 
 		 279 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2364  hypothetical protein  32.32 
 
 		 279 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.09488  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8784  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.5 
 
 		 222 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3623  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.81 
 
 		 216 aa  127  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2853  hypothetical protein  34.23 
 
 		 282 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889205  normal  0.120479 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0113  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 		 206 aa  114  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2769  hypothetical protein  36.87 
 
 		 280 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2923  hypothetical protein  36.87 
 
 		 285 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2122  hypothetical protein  34.36 
 
 		 278 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0384708  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  41.56 
 
 		 210 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.82 
 
 		 217 aa  109  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.43 
 
 		 202 aa  109  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.84 
 
 		 200 aa  107  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4766  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.93 
 
 		 309 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.11 
 
 		 205 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.94 
 
 		 210 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.11 
 
 		 245 aa  103  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4246  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.91 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.91 
 
 		 201 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4616  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.91 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259396  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.2 
 
 		 315 aa  100  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.11 
 
 		 304 aa  100  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.29 
 
 		 193 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.11 
 
 		 249 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.29 
 
 		 193 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 		 209 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.89 
 
 		 295 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.35 
 
 		 231 aa  97.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 		 186 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>