More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6587 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  219  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  99.11 
 
 		 112 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  94.64 
 
 		 112 aa  208  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  94.64 
 
 		 112 aa  207  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  94.64 
 
 		 112 aa  207  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  94.64 
 
 		 112 aa  207  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  89.29 
 
 		 112 aa  199  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 		 112 aa  197  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 		 112 aa  196  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 		 112 aa  196  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 		 112 aa  196  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 		 112 aa  196  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  87.5 
 
 		 112 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 		 112 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 		 112 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  84.82 
 
 		 112 aa  193  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 		 112 aa  193  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 		 112 aa  193  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 		 112 aa  193  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  85.71 
 
 		 112 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  85.71 
 
 		 112 aa  191  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 		 112 aa  190  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 		 112 aa  190  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 		 112 aa  190  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  83.04 
 
 		 112 aa  185  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 		 112 aa  184  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  184  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  179  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  179  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1838  putative nitrogen regulation protein PII  77.68 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  73.21 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.21 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  74.11 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  72.32 
 
 		 112 aa  169  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 136 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  68.75 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  68.75 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  72.32 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  73.21 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  70.54 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 114 aa  167  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1023  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  73.21 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  73.21 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>