More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6562 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  88.89 
 
 		 221 aa  373  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  68.97 
 
 		 220 aa  277  9e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  68.97 
 
 		 220 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  69.19 
 
 		 220 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  67.68 
 
 		 212 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  53.17 
 
 		 213 aa  208  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  49.75 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  44.66 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  39.58 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 226 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 		 226 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  40.31 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 214 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 217 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  38.14 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  40.09 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 228 aa  95.1  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  31.12 
 
 		 250 aa  92.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 234 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  33.85 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  31.34 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 257 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  34.29 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 237 aa  85.5  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  38.99 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 192 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  32.12 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
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NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  34.29 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  36.51 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  36 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  34.15 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
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NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
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NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
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NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
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