More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6552 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  100 
 
 		 417 aa  853    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  96.4 
 
 		 417 aa  836    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  71.76 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  69.08 
 
 		 402 aa  588  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  69.08 
 
 		 402 aa  589  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  69.08 
 
 		 402 aa  586  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  67.83 
 
 		 402 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  71.61 
 
 		 415 aa  569  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  71.03 
 
 		 421 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  62.44 
 
 		 395 aa  496  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  55.93 
 
 		 391 aa  457  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  54.12 
 
 		 391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  55.5 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  56.02 
 
 		 396 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  56.61 
 
 		 400 aa  435  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  58.73 
 
 		 396 aa  435  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  56.81 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  56.41 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  54.69 
 
 		 396 aa  418  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  50.77 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  50.26 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  52.88 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  54.45 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  51.68 
 
 		 422 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  50.4 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  50.26 
 
 		 406 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  52.94 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  50.63 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  48.96 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  52.43 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  49.87 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  51.44 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  49.74 
 
 		 415 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  52.07 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  52.17 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  50.78 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  48.6 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  48.49 
 
 		 403 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  49.47 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  49.1 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  50.13 
 
 		 401 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  46.51 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  47.68 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  50 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  47.74 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4911  aminotransferase class V  50.67 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4373  Serine--glyoxylate transaminase  48.52 
 
 		 397 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1369  Serine--glyoxylate transaminase  45.95 
 
 		 397 aa  317  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  39.79 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  37.56 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  40.16 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  40.16 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0544  putative aminotransferase, class V  38.23 
 
 		 395 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  36.6 
 
 		 384 aa  265  8e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  40.77 
 
 		 382 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  38.02 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0780  Serine--glyoxylate transaminase  37.5 
 
 		 395 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  37.01 
 
 		 384 aa  261  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  38.85 
 
 		 383 aa  259  8e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4629  Serine--glyoxylate transaminase  38.27 
 
 		 395 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  38.64 
 
 		 385 aa  256  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.08 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0857  aminotransferase class V  37.5 
 
 		 395 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  36.84 
 
 		 382 aa  252  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  39.47 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4689  aminotransferase, class V  37.56 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  38.32 
 
 		 385 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  36.55 
 
 		 385 aa  242  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  34.97 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  39.94 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  37.09 
 
 		 362 aa  239  5e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  37.09 
 
 		 362 aa  239  5e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.36 
 
 		 362 aa  239  8e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  36.02 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  39.94 
 
 		 363 aa  237  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  36.1 
 
 		 381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  37.54 
 
 		 386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  35.26 
 
 		 382 aa  236  7e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  35.25 
 
 		 382 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.81 
 
 		 387 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  34.99 
 
 		 379 aa  232  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  34.81 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  36.34 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  34.19 
 
 		 385 aa  229  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.64 
 
 		 387 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  34.47 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  34.47 
 
 		 379 aa  228  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  38.12 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.95 
 
 		 382 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  32.98 
 
 		 379 aa  227  4e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  35.08 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  34.65 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.05 
 
 		 383 aa  223  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  33.85 
 
 		 387 aa  219  7e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  36.9 
 
 		 397 aa  219  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3472  aminotransferase, class V  36.95 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2018  Serine--glyoxylate transaminase  37.4 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  35.53 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  32.71 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>