217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6531 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  100 
 
 		 443 aa  859    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  92.49 
 
 		 447 aa  733    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  52.66 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  52.19 
 
 		 482 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  52.19 
 
 		 482 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  53.46 
 
 		 461 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  52.02 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  47.75 
 
 		 466 aa  365  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  44.59 
 
 		 471 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  44.54 
 
 		 471 aa  356  5e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  43.67 
 
 		 461 aa  354  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  44.1 
 
 		 465 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  43.97 
 
 		 463 aa  353  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  44.32 
 
 		 463 aa  352  5e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  44.62 
 
 		 472 aa  352  7e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 471 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 471 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  42.41 
 
 		 476 aa  350  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 472 aa  347  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  45.29 
 
 		 465 aa  347  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  47.51 
 
 		 466 aa  347  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 471 aa  346  5e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  47.36 
 
 		 475 aa  339  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  45.35 
 
 		 478 aa  339  7e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  47.81 
 
 		 466 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  46.44 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  47.83 
 
 		 450 aa  325  8.000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  49.37 
 
 		 447 aa  325  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  45.92 
 
 		 478 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  48.73 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  47.22 
 
 		 449 aa  319  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  45.91 
 
 		 417 aa  319  7.999999999999999e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 450 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  48.09 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  48.33 
 
 		 444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  40.61 
 
 		 475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  43.95 
 
 		 461 aa  307  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  47.47 
 
 		 462 aa  306  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  43.43 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4016  major facilitator transporter  44.96 
 
 		 444 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8458  major facilitator superfamily MFS_1  43.56 
 
 		 442 aa  296  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  43.39 
 
 		 457 aa  293  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  41.45 
 
 		 439 aa  292  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 468 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  44.81 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 		 452 aa  253  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 417 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 		 425 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  39.19 
 
 		 492 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  39.86 
 
 		 426 aa  246  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  38.8 
 
 		 429 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 443 aa  243  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  39.28 
 
 		 429 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  36.14 
 
 		 495 aa  239  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  37.68 
 
 		 491 aa  239  8e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  37.68 
 
 		 491 aa  239  8e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  37.68 
 
 		 491 aa  239  8e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 454 aa  239  8e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  37.68 
 
 		 491 aa  239  8e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  37.68 
 
 		 491 aa  239  9e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  37.68 
 
 		 491 aa  239  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  37.68 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  35.47 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  37.68 
 
 		 491 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 416 aa  237  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  37.68 
 
 		 491 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  35.56 
 
 		 428 aa  238  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  35.63 
 
 		 492 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  35.63 
 
 		 492 aa  237  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  36.39 
 
 		 495 aa  237  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  36.86 
 
 		 491 aa  237  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  35.39 
 
 		 492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  38.16 
 
 		 491 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  38.16 
 
 		 491 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  38.16 
 
 		 493 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  38.16 
 
 		 493 aa  233  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 416 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  38.16 
 
 		 491 aa  232  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 412 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 388 aa  229  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  33.01 
 
 		 424 aa  226  6e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 452 aa  225  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 455 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  35.31 
 
 		 433 aa  223  8e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  39.13 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  35.06 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  38.87 
 
 		 409 aa  221  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  34.04 
 
 		 489 aa  220  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03281  hypothetical protein  35.64 
 
 		 409 aa  219  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  41.12 
 
 		 463 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  37.16 
 
 		 460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  33.65 
 
 		 447 aa  216  8e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  34.43 
 
 		 448 aa  216  8e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>