More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6453 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  82.18 
 
 
403 aa  678  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
401 aa  806  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  82.95 
 
 
402 aa  675  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  73.95 
 
 
403 aa  614  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  73.88 
 
 
402 aa  592  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  72.29 
 
 
401 aa  583  1e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  67.82 
 
 
405 aa  574  1e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  67.82 
 
 
405 aa  574  1e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  67 
 
 
402 aa  551  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  66.01 
 
 
410 aa  531  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  64.65 
 
 
400 aa  526  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  67.32 
 
 
417 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  68.28 
 
 
406 aa  525  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  61.54 
 
 
408 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.78 
 
 
406 aa  479  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  70.93 
 
 
379 aa  451  1e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  52.58 
 
 
414 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  55 
 
 
414 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  57.68 
 
 
407 aa  401  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  51.24 
 
 
446 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  53.41 
 
 
412 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.6 
 
 
416 aa  356  4e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  41.12 
 
 
412 aa  329  6e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.11038e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  46.92 
 
 
434 aa  308  9e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  46.58 
 
 
426 aa  306  4e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  41.39 
 
 
370 aa  212  8e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  33.81 
 
 
451 aa  209  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  32.93 
 
 
409 aa  200  4e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.15 
 
 
453 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  36.48 
 
 
372 aa  186  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  36.49 
 
 
369 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  36.59 
 
 
369 aa  184  2e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  33.57 
 
 
461 aa  180  3e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  36.92 
 
 
369 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
461 aa  179  6e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  31.48 
 
 
410 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.98 
 
 
416 aa  176  9e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.06 
 
 
417 aa  175  2e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  38.44 
 
 
414 aa  174  2e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  36.45 
 
 
369 aa  174  3e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  37.29 
 
 
361 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  34.08 
 
 
406 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  33.83 
 
 
420 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.3 
 
 
411 aa  169  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.27 
 
 
412 aa  166  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.27 
 
 
412 aa  166  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  34.12 
 
 
417 aa  164  2e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  34.23 
 
 
408 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18836e-05 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  33.53 
 
 
363 aa  163  5e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  30.2 
 
 
457 aa  159  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  32.01 
 
 
409 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  33.93 
 
 
408 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  35.07 
 
 
407 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  37.8 
 
 
376 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  35.18 
 
 
359 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  34.17 
 
 
367 aa  156  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.78626e-15  hitchhiker  6.08481e-12 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.83 
 
 
415 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.98483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.09 
 
 
409 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.15 
 
 
405 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.95 
 
 
408 aa  147  4e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.04 
 
 
408 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  5.59992e-07 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  32.13 
 
 
407 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.61 
 
 
400 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  31.89 
 
 
431 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  28.95 
 
 
408 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  27.87 
 
 
408 aa  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  35.44 
 
 
429 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  33.02 
 
 
440 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  32.28 
 
 
425 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  32.31 
 
 
428 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  32.31 
 
 
428 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  5.38057e-06 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  31.33 
 
 
425 aa  137  3e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
430 aa  137  3e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.82 
 
 
501 aa  135  1e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  31.95 
 
 
423 aa  132  1e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  32.82 
 
 
409 aa  131  2e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.58 
 
 
501 aa  131  2e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  32.4 
 
 
437 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  31.41 
 
 
427 aa  130  4e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  32.4 
 
 
425 aa  130  4e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.85 
 
 
508 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.32 
 
 
415 aa  129  8e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  5.68946e-05 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  30.88 
 
 
405 aa  127  2e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  33.46 
 
 
431 aa  128  2e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  34.74 
 
 
402 aa  125  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  34.74 
 
 
406 aa  125  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  33.54 
 
 
414 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.82 
 
 
465 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  34.12 
 
 
349 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  32.08 
 
 
414 aa  123  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  32.91 
 
 
424 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  30.28 
 
 
420 aa  122  1e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.06 
 
 
430 aa  121  2e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.99 
 
 
456 aa  121  2e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  29.13 
 
 
437 aa  121  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  30.79 
 
 
414 aa  120  4e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  31.23 
 
 
531 aa  119  1e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  32.79 
 
 
542 aa  119  1e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  29.73 
 
 
380 aa  119  1e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  31.31 
 
 
419 aa  119  1e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>