119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6424 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  66.16 
 
 		 326 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  65.37 
 
 		 354 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5292  hypothetical protein  44 
 
 		 327 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.562532  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1882  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  90.76 
 
 		 133 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  37.84 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  33.73 
 
 		 365 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0039  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  35.03 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  35.65 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1048  hypothetical protein  37.04 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5660  hypothetical protein  32.02 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6911  hypothetical protein  32.51 
 
 		 329 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7008  hypothetical protein  31.93 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1481  hypothetical protein  32.17 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2818  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  31.23 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6747  hypothetical protein  29.63 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  28.78 
 
 		 329 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2904  hypothetical protein  30.42 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5656  hypothetical protein  31.55 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  27.46 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  28.76 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  31.03 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  30.45 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  30.21 
 
 		 317 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  30.45 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  29.51 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  27.34 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  29.31 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.14 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  28.62 
 
 		 322 aa  106  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  28.97 
 
 		 322 aa  105  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  30.04 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.79 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  26.02 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  27.59 
 
 		 343 aa  103  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4781  protein of unknown function DUF534  25.78 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  30.31 
 
 		 324 aa  99.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  28.81 
 
 		 325 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  28.18 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  27.56 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  28.81 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  26.67 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  27.3 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  30.77 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  28.22 
 
 		 322 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  28.52 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  25.5 
 
 		 584 aa  95.5  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  27.49 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.06 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  27.49 
 
 		 341 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.06 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  24.85 
 
 		 333 aa  94.4  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  26.13 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  29.06 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.06 
 
 		 323 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.06 
 
 		 323 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.06 
 
 		 323 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.06 
 
 		 323 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  29.06 
 
 		 321 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  27.24 
 
 		 337 aa  92.4  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.68 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  26.48 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  28.68 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  24.73 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  28.3 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  28.3 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  28.3 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  28.92 
 
 		 340 aa  89.7  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  28.87 
 
 		 329 aa  89.4  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  28.33 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  26.2 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  26.62 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  27.99 
 
 		 326 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  28.18 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  24.81 
 
 		 329 aa  85.9  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  24.21 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.69 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  27.11 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  27.4 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.88 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  26.92 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  26.81 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  28 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  28.57 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  26.6 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.57 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  26.16 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.74 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  25.85 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  25.53 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  24.21 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  20.62 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  23.71 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2628  hypothetical protein  25.17 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  23.24 
 
 		 640 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  25.89 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  24.26 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  21.33 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  24.37 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.09 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>