77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6325 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6325  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 148 aa  285  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662138 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1502  NUDIX hydrolase  53.44 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.519776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23100  hypothetical protein  53.24 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691399  hitchhiker  0.00085888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1950  hypothetical protein  53.24 
 
 		 145 aa  143  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00937035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1436  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0195  ADP-ribose pyrophosphatase  38.97 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0128  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0968691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 		 183 aa  110  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1974  MutT/nudix family protein  38.17 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2319  NUDIX hydrolase  44.27 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.734141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  43.64 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  32.32 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  32.38 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2293  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  43.75 
 
 		 565 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0901  dinucleoside polyphosphate hydrolase  50.88 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0122  NUDIX hydrolase  26 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.151364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1148  hypothetical protein  27.59 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504849  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  46.34 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 525 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  47.06 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  46.81 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  46.3 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  31.53 
 
 		 255 aa  43.9  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  54.05 
 
 		 282 aa  42.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0561  dinucleoside polyphosphate hydrolase  46.77 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.655956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  47.83 
 
 		 347 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0205  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.33 
 
 		 338 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.445871 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  51.43 
 
 		 352 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0906  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000252658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 		 291 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2193  NUDIX hydrolase  27.64 
 
 		 168 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52802  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  29.46 
 
 		 180 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  52.78 
 
 		 150 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  30.85 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0038  mutator MutT protein  32.26 
 
 		 158 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.934517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  38.67 
 
 		 144 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 148 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0170  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.16 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  39.22 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 253 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  43.33 
 
 		 383 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  31.52 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4733  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580905  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36667  predicted protein  26.92 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179207 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  38.57 
 
 		 358 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  29.27 
 
 		 345 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  26.98 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  45.24 
 
 		 316 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  40.68 
 
 		 322 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  35.29 
 
 		 399 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4142  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.34 
 
 		 346 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  40 
 
 		 320 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  40 
 
 		 320 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  27.91 
 
 		 325 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>