216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6298 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6298  MucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  283  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  88.73 
 
 		 145 aa  253  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  76.74 
 
 		 171 aa  203  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  79.51 
 
 		 160 aa  201  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  72.18 
 
 		 166 aa  200  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  73.23 
 
 		 164 aa  192  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  71.54 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1890  MucR family transcriptional regulator  68.7 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 133 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  72 
 
 		 160 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  68.22 
 
 		 145 aa  187  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  68.7 
 
 		 133 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  70.16 
 
 		 162 aa  185  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  69.47 
 
 		 133 aa  186  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6742  MucR family transcriptional regulator  69.6 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5073  transcriptional regulator, MucR family  71.54 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  70.31 
 
 		 144 aa  184  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4944  MucR family transcriptional regulator  75 
 
 		 158 aa  184  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  61.15 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3684  transcriptional regulator, MucR family  71.54 
 
 		 162 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  70.73 
 
 		 163 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2620  transcriptional regulator, MucR family  68.5 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2484  transcriptional regulator, MucR family  70.54 
 
 		 134 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  69.6 
 
 		 164 aa  180  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0608  MucR family transcriptional regulator  70.68 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0460505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  64.18 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0549  transcriptional regulator, MucR family  64.18 
 
 		 147 aa  177  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6541  transcriptional regulator, MucR family  68.6 
 
 		 144 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  64.23 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5488  MucR family transcriptional regulator  68.5 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622801  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4087  transcriptional regulator, MucR family  69.35 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  70.49 
 
 		 134 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  70.83 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4253  transcriptional regulator, MucR family  70.08 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  67.19 
 
 		 135 aa  174  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3559  transcriptional regulator, MucR family  65.65 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  66.94 
 
 		 164 aa  173  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  68.55 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4097  MucR family transcriptional regulator  64.18 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3504  transcriptional regulator, MucR family  73.77 
 
 		 131 aa  167  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8789  transcriptional regulator, MucR family  61.94 
 
 		 147 aa  166  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4116  MucR family transcriptional regulator  71.2 
 
 		 140 aa  166  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5626  transcriptional regulator, MucR family  71.31 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.63695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0075  MucR family transcriptional regulator  59.2 
 
 		 166 aa  160  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0587  MucR family transcriptional regulator  61.83 
 
 		 157 aa  160  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0109398  hitchhiker  0.00472777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4474  ROSMUCR transcriptional regulator  55.97 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4938  transcriptional regulator, MucR family  55.97 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686756  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  61.36 
 
 		 168 aa  157  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 174 aa  156  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0124  transcriptional regulator, MucR family  59.84 
 
 		 137 aa  156  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4988  transcriptional regulator, MucR family  55.8 
 
 		 177 aa  155  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103901  normal  0.173335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4669  MucR family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 169 aa  155  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2100  transcriptional regulator, MucR family  62.14 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6343  transcriptional regulator, MucR family  55.8 
 
 		 189 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  62.3 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 138 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  55.47 
 
 		 138 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4896  MucR family transcriptional regulator  55.3 
 
 		 180 aa  150  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127609  hitchhiker  0.00352911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  60.94 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  55.47 
 
 		 175 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  60.94 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  55.47 
 
 		 175 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5176  MucR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 190 aa  150  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  58.33 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  59.09 
 
 		 145 aa  150  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2952  transcriptional regulator, MucR family  61.42 
 
 		 160 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 138 aa  148  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1345  transcriptional regulator, MucR family  52.99 
 
 		 166 aa  148  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000373643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1517  MucR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400145  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8284  transcriptional regulator, MucR family  54.48 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647815  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8753  transcriptional regulator, MucR family  54.81 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286217  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4811  transcriptional regulator, MucR family  51.49 
 
 		 166 aa  147  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  52.94 
 
 		 137 aa  147  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  59.2 
 
 		 174 aa  147  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5185  MucR family transcriptional regulator  60 
 
 		 185 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238338  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4660  transcriptional regulator, MucR family  53.85 
 
 		 139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20016  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  56.82 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  56.82 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  53.28 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4977  transcriptional regulator, MucR family  54.33 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1282  transcriptional regulator, MucR family  53.54 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4157  transcriptional regulator, MucR family  60 
 
 		 141 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3787  ROSMUCR transcriptional regulator  57.36 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0082  transcriptional regulator, MucR family  53.6 
 
 		 197 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4927  transcriptional regulator, MucR family  53.91 
 
 		 177 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  55.91 
 
 		 137 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4463  ROSMUCR transcriptional regulator  54.4 
 
 		 177 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3505  transcriptional regulator, MucR family  56.49 
 
 		 174 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5627  transcriptional regulator, MucR family  56.49 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.698408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6743  MucR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 156 aa  141  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328928  normal  0.300512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 137 aa  141  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7826  transcriptional regulator, MucR family  56.39 
 
 		 174 aa  141  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>