More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6222 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  100 
 
 
302 aa  588  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  83.39 
 
 
301 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  62.55 
 
 
333 aa  353  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  57.24 
 
 
316 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  61.7 
 
 
331 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  57.05 
 
 
314 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  67.61 
 
 
323 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  48.7 
 
 
312 aa  296  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  51.16 
 
 
310 aa  288  9e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  51.15 
 
 
311 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  53.36 
 
 
271 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  45.45 
 
 
309 aa  276  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  48.03 
 
 
308 aa  275  8e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  49.5 
 
 
309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  50 
 
 
317 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  49.17 
 
 
309 aa  272  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  50.94 
 
 
307 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  46.46 
 
 
305 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  51.31 
 
 
305 aa  268  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  47.47 
 
 
302 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  50.18 
 
 
306 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  48.91 
 
 
302 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  49.29 
 
 
307 aa  258  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  47.9 
 
 
303 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  50 
 
 
317 aa  255  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  49.06 
 
 
305 aa  255  8e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  47.2 
 
 
303 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  48.3 
 
 
301 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  47.83 
 
 
304 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  48.63 
 
 
272 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  51.74 
 
 
277 aa  246  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  44.14 
 
 
296 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  40.91 
 
 
345 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  40 
 
 
271 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.27 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.88 
 
 
282 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.88 
 
 
282 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.88 
 
 
282 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.88 
 
 
282 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0138  aldo/keto reductase  32.38 
 
 
279 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  36.67 
 
 
280 aa  99  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1156  aldo/keto reductase  35.32 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721286  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0784  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
281 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.756682  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3054  aldo/keto reductase  33.46 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00284405  normal  0.275576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  33.2 
 
 
277 aa  95.5  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  32.35 
 
 
281 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3181  aldo/keto reductase  33.58 
 
 
281 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000770886 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  29.57 
 
 
281 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3732  aldo/keto reductase  32.08 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0755  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.06 
 
 
281 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.181791  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5799  aldo/keto reductase  34.85 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1673  aldo/keto reductase  31.1 
 
 
284 aa  94  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1975  aldo/keto reductase  31.27 
 
 
284 aa  92.4  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2824  putative aldo/keto reductase  30.51 
 
 
279 aa  92.4  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0706  aldo/keto reductase  26.12 
 
 
284 aa  92  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000923637  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1101  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.26 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.16541  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  30.56 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2256  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.26 
 
 
281 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  32.27 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2217  aldo/keto reductase  32.02 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0551  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.26 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0948  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.26 
 
 
286 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0952  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.26 
 
 
281 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2128  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.26 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2555  aldo/keto reductase  32.94 
 
 
281 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324951 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.23 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  32.53 
 
 
314 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1919  aldo/keto reductase  32.94 
 
 
281 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  30.22 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2429  aldo/keto reductase  33.83 
 
 
270 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43714  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2531  aldo/keto reductase  32.94 
 
 
281 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383161  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1308  aldo/keto reductase  28.94 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2505  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.25 
 
 
284 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  35.14 
 
 
342 aa  89.7  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5289  aldo/keto reductase  34.4 
 
 
279 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3195  aldo/keto reductase  34.63 
 
 
288 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2369  aldo/keto reductase  29.53 
 
 
294 aa  89  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2737  aldo/keto reductase  32.1 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2449  aldo/keto reductase  32.94 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000271935 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01750  predicted oxidoreductase  30.47 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.725881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1861  aldo/keto reductase  30.47 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000447998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1866  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.47 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00718625  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4714  oxidoreductase  33.07 
 
 
273 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1997  aldo/keto reductase  30.71 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01738  hypothetical protein  30.47 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723055  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  28.15 
 
 
410 aa  87.8  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1851  aldo/keto reductase  30.47 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0581012  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2881  aldo/keto reductase  33.46 
 
 
277 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5774  aldo/keto reductase  34.38 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2596  aldo/keto reductase  32.6 
 
 
273 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  34.98 
 
 
331 aa  87  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  30 
 
 
331 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1410  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.86 
 
 
284 aa  87  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2029  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.13 
 
 
284 aa  86.7  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.848992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  34.5 
 
 
327 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0142  aldo/keto reductase  28.85 
 
 
280 aa  86.3  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2442  aldo/keto reductase  34.82 
 
 
281 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0764  aldo/keto reductase  33.99 
 
 
281 aa  85.9  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421466 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  29 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  29 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>