33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6052 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  78.77 
 
 
528 aa  666    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  100 
 
 
546 aa  1061    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  46.04 
 
 
592 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  45.68 
 
 
597 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  46.24 
 
 
647 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  46.57 
 
 
646 aa  375  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  34.28 
 
 
563 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  34.76 
 
 
566 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  35.1 
 
 
540 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  36.75 
 
 
568 aa  236  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  37 
 
 
563 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  35.75 
 
 
571 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  35.93 
 
 
564 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  31.12 
 
 
617 aa  204  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  30.28 
 
 
590 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  28.24 
 
 
528 aa  161  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  28.16 
 
 
552 aa  153  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  30.2 
 
 
423 aa  153  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  28.11 
 
 
512 aa  150  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  28.44 
 
 
502 aa  150  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  31.09 
 
 
515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  26.03 
 
 
511 aa  126  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  26.85 
 
 
513 aa  124  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  28.01 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  29.1 
 
 
505 aa  110  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  25.83 
 
 
424 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  26.7 
 
 
420 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  25.13 
 
 
537 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  23.39 
 
 
451 aa  90.5  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  24.62 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0735  hypothetical protein  24.53 
 
 
437 aa  62  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0886223  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0809  hypothetical protein  21.85 
 
 
394 aa  48.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1174  hypothetical protein  27.42 
 
 
477 aa  47.4  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.605378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>