More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5885 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  71.42 
 
 
1043 aa  1341  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
1065 aa  2043  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  33.4 
 
 
1048 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  32.83 
 
 
1105 aa  441  1e-122  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  35.53 
 
 
1122 aa  429  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.48 
 
 
1175 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  31.38 
 
 
1046 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  34.25 
 
 
1227 aa  352  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  30.85 
 
 
1037 aa  336  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  29.48 
 
 
1148 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  30.02 
 
 
1139 aa  319  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  28.81 
 
 
1055 aa  313  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  30.56 
 
 
1138 aa  310  7e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  29.32 
 
 
1151 aa  310  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.35 
 
 
1151 aa  306  1e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 
1398 aa  305  2e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.76 
 
 
1149 aa  295  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.05 
 
 
1141 aa  289  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 
1403 aa  280  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 
1402 aa  255  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.64 
 
 
1117 aa  254  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.44 
 
 
1291 aa  234  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  28.35 
 
 
1134 aa  228  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.88 
 
 
1089 aa  225  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  27.73 
 
 
1093 aa  223  2e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  28.45 
 
 
1160 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  27.48 
 
 
1133 aa  211  8e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 
1311 aa  207  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  28.56 
 
 
1027 aa  207  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 
1027 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.1 
 
 
1055 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 
1027 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.84 
 
 
1023 aa  204  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  32.31 
 
 
1198 aa  196  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  27.98 
 
 
1123 aa  194  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.46 
 
 
1081 aa  193  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.85 
 
 
1403 aa  193  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.12 
 
 
1087 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  30.65 
 
 
1358 aa  186  2e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.86 
 
 
1080 aa  186  2e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  30.11 
 
 
1050 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.11 
 
 
1050 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  28.24 
 
 
1142 aa  181  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.81 
 
 
1053 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.08 
 
 
1360 aa  179  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  29.91 
 
 
914 aa  176  2e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.13 
 
 
1014 aa  169  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  27.63 
 
 
1094 aa  166  2e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.67 
 
 
1422 aa  164  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.15 
 
 
1429 aa  157  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  25.02 
 
 
1349 aa  155  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  25.25 
 
 
1348 aa  153  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
1298 aa  150  1e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.04 
 
 
1096 aa  148  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  30.63 
 
 
1063 aa  145  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  25.44 
 
 
1342 aa  144  1e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  28.16 
 
 
1353 aa  144  1e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  26.62 
 
 
1271 aa  141  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.22 
 
 
1441 aa  140  9e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  25.34 
 
 
1349 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  25.34 
 
 
1349 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 
1359 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  27.93 
 
 
1213 aa  138  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  27.91 
 
 
1359 aa  139  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  27.97 
 
 
1359 aa  138  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  27.93 
 
 
1350 aa  138  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  27.81 
 
 
1359 aa  138  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  27.81 
 
 
1359 aa  138  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.02 
 
 
805 aa  137  1e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.74 
 
 
1226 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  26.25 
 
 
1289 aa  133  2e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  27.95 
 
 
1204 aa  131  8e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  38.5 
 
 
665 aa  125  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.92 
 
 
1295 aa  123  2e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.41 
 
 
1285 aa  121  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  18.71 
 
 
1153 aa  119  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.38 
 
 
1126 aa  119  4e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  25.4 
 
 
956 aa  117  9e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.16 
 
 
611 aa  110  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  25.08 
 
 
1264 aa  108  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  3.02868e-06 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  28.07 
 
 
967 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  24.38 
 
 
1130 aa  106  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
973 aa  106  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  34.92 
 
 
526 aa  105  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  30.92 
 
 
460 aa  104  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11521e-07 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  32.81 
 
 
524 aa  104  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  34.16 
 
 
320 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  34.16 
 
 
320 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
529 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  26.18 
 
 
1169 aa  102  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  32.66 
 
 
526 aa  102  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  30.42 
 
 
954 aa  101  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  32.81 
 
 
662 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  31.41 
 
 
983 aa  101  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  29.02 
 
 
1383 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  30.79 
 
 
966 aa  100  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  28.5 
 
 
479 aa  99.4  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 
981 aa  99.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.57 
 
 
1190 aa  99.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1662  adenylate/guanylate cyclase  31.47 
 
 
472 aa  99.4  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.491568  hitchhiker  0.000617786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>