41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5867 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5867  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  370  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244323  normal  0.372797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6375  protein of unknown function DUF302  74.1 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0376  protein of unknown function DUF302  43.12 
 
 		 148 aa  101  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1896  hypothetical protein  41.13 
 
 		 135 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1369  crcB family protein  41.96 
 
 		 254 aa  92.8  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 		 270 aa  92.8  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3845  protein of unknown function DUF302  43.4 
 
 		 133 aa  92  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0744952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1260  hypothetical protein  42.45 
 
 		 157 aa  89  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3395  hypothetical protein  40.8 
 
 		 160 aa  88.2  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0949  hypothetical protein  31.97 
 
 		 150 aa  87.8  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.811465  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1823  hypothetical protein  40.95 
 
 		 131 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2075  hypothetical protein  38.84 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1673  hypothetical protein  34.48 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00536019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1941  hypothetical protein  34.29 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8650  protein of unknown function DUF302  37.5 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1380  protein of unknown function DUF302  34.56 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001057  putative inner membrane or exported protein  33.96 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8087  protein of unknown function DUF302  31.61 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2874  hypothetical protein  31.5 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2096  hypothetical protein  28.69 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1764  protein of unknown function DUF302  33.96 
 
 		 154 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2704  hypothetical protein  34.55 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556991  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2735  hypothetical protein  30.19 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4835  hypothetical protein  35.64 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0512  hypothetical protein  26.72 
 
 		 152 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.915743  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2556  hypothetical protein  35.61 
 
 		 150 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05960  hypothetical protein  22.96 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0678707  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0349  periplasmic protein  29.36 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.112084  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4909  domain of unknown function superfamily  31.15 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4906  hypothetical protein  34.62 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4835  hypothetical protein  34.62 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.770482  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4759  hypothetical protein  34.62 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  0.706872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4859  hypothetical protein  34.62 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.103571 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5442  hypothetical protein  40.43 
 
 		 138 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1665  hypothetical protein  33.72 
 
 		 149 aa  54.3  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0543  protein of unknown function DUF302  31.87 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1272  hypothetical protein  24.27 
 
 		 121 aa  52.8  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1779  hypothetical protein  27.78 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2794  hypothetical protein  37.8 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.4262  normal  0.709682 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0007  protein of unknown function DUF302  32.03 
 
 		 135 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1559  protein of unknown function DUF302  32.88 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874349  normal  0.0163758 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>