More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5861 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
345 aa  686    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  88.41 
 
 
345 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6288  extracellular solute-binding protein  79.3 
 
 
341 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0579  extracellular solute-binding protein family 1  76.13 
 
 
341 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0570  extracellular solute-binding protein  75.83 
 
 
341 aa  504  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0543  extracellular solute-binding protein family 1  73.94 
 
 
341 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  65.73 
 
 
338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  66.25 
 
 
380 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  66.36 
 
 
338 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  65.22 
 
 
362 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  66.35 
 
 
337 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  66.25 
 
 
347 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  66.98 
 
 
354 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  64.8 
 
 
347 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  65.3 
 
 
347 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  67.19 
 
 
351 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  64.49 
 
 
347 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  67.19 
 
 
351 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  66.88 
 
 
351 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  64.67 
 
 
347 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  66.88 
 
 
351 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  64.98 
 
 
347 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  67.19 
 
 
351 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  67.19 
 
 
351 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  64.98 
 
 
347 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  66.88 
 
 
351 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  63.51 
 
 
347 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  58.28 
 
 
348 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  60.06 
 
 
349 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  58.36 
 
 
349 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  54.28 
 
 
346 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  55.42 
 
 
336 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  55.8 
 
 
338 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  55.31 
 
 
338 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  54.04 
 
 
337 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  51.91 
 
 
336 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.48 
 
 
336 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  53.48 
 
 
336 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  51.92 
 
 
347 aa  339  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  50.62 
 
 
337 aa  332  5e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  47.08 
 
 
352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  46.33 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  46.63 
 
 
337 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  46.92 
 
 
337 aa  325  5e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  48.07 
 
 
335 aa  324  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  47.73 
 
 
335 aa  322  6e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  47.43 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  47.24 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  47.55 
 
 
335 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  45.61 
 
 
339 aa  320  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  48.44 
 
 
335 aa  319  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  47.24 
 
 
335 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  47.13 
 
 
335 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  46.63 
 
 
335 aa  315  8e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  47.92 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  43.99 
 
 
335 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  46.27 
 
 
335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  45.13 
 
 
335 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  43.66 
 
 
335 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  42.64 
 
 
335 aa  296  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  43.24 
 
 
335 aa  294  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 
355 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  45.23 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  43.03 
 
 
374 aa  251  9.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  44.94 
 
 
345 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  42.14 
 
 
365 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  39.66 
 
 
355 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  42.14 
 
 
365 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  39.82 
 
 
347 aa  248  8e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  43.36 
 
 
337 aa  248  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  40.62 
 
 
339 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  41.8 
 
 
374 aa  247  3e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  42.09 
 
 
341 aa  246  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  41.89 
 
 
347 aa  245  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  42.72 
 
 
348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  42.01 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  43.69 
 
 
352 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  41.84 
 
 
349 aa  243  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  39.94 
 
 
335 aa  242  6e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  42.86 
 
 
366 aa  242  9e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  42.63 
 
 
337 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  42.21 
 
 
351 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  44.06 
 
 
347 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  36.23 
 
 
351 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  41.09 
 
 
335 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  43.93 
 
 
345 aa  238  8e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  44.75 
 
 
349 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  39.13 
 
 
337 aa  235  8e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  39.68 
 
 
346 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  37.92 
 
 
347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 
337 aa  233  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  42.33 
 
 
347 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  44.44 
 
 
347 aa  233  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  37.62 
 
 
334 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  37.93 
 
 
334 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  38.92 
 
 
340 aa  229  5e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  40.44 
 
 
372 aa  229  7e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  37.3 
 
 
334 aa  228  9e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  39.53 
 
 
349 aa  226  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 
336 aa  225  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>