243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5751 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 321 aa  622  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  83.8 
 
 		 315 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  62.94 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  54.01 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  50.31 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  48.78 
 
 		 349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  43.69 
 
 		 314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  49.29 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  45.8 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  43.85 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  47.52 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  47.52 
 
 		 310 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  43.12 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  45.26 
 
 		 320 aa  222  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  44.14 
 
 		 364 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  43.79 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  41.55 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 		 351 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  35.74 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  32.91 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  35.51 
 
 		 302 aa  126  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  36.28 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  30.43 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  38.8 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  31.68 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  31.14 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  36.65 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 315 aa  109  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  32.94 
 
 		 271 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  31.79 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  32.64 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 305 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  31.73 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  31.87 
 
 		 351 aa  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  35.46 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  21.31 
 
 		 310 aa  99  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  33.63 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  33.63 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  35 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  27.27 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  32.88 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  33.07 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  33.07 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  34.03 
 
 		 319 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  34.03 
 
 		 319 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  31.34 
 
 		 271 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  34 
 
 		 307 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  34 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  27.61 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  29.83 
 
 		 343 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  32.51 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 		 315 aa  92.4  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 336 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  33.51 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  34.03 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  33.03 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  31.62 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  29.22 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  32.98 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  32.51 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  28.89 
 
 		 337 aa  89.7  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  31.13 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  30.07 
 
 		 322 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  30.07 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  30.3 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  22.14 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 		 597 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  31.09 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  32.05 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  27.59 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  27.46 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  23.89 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  27.53 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  28.78 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  29.61 
 
 		 644 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>