72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5712 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5712  putative cell volume regulation protein A  100 
 
 		 82 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0175754 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  56.34 
 
 		 607 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  54.69 
 
 		 598 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  48.53 
 
 		 596 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  47.06 
 
 		 596 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  47.06 
 
 		 596 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  47.06 
 
 		 596 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  77.46 
 
 		 609 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  45.33 
 
 		 623 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  47.06 
 
 		 596 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  47.06 
 
 		 596 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  47.06 
 
 		 596 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  54.69 
 
 		 602 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  52.24 
 
 		 608 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  56.25 
 
 		 599 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  52.24 
 
 		 601 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  51.56 
 
 		 599 aa  67  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  50.75 
 
 		 601 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  50.75 
 
 		 601 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  50.77 
 
 		 611 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  50.77 
 
 		 611 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  47.83 
 
 		 604 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  50 
 
 		 597 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 		 622 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  46.27 
 
 		 595 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  45.71 
 
 		 611 aa  62  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  44.78 
 
 		 760 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  37.18 
 
 		 637 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  38.46 
 
 		 616 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  53.73 
 
 		 616 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  47.54 
 
 		 619 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  43.94 
 
 		 607 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  53.12 
 
 		 741 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  48.57 
 
 		 637 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  53.97 
 
 		 584 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  47.44 
 
 		 640 aa  57.4  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  38.96 
 
 		 651 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  43.28 
 
 		 606 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  50.88 
 
 		 602 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  41.67 
 
 		 610 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  43.59 
 
 		 641 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  44.78 
 
 		 764 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  43.24 
 
 		 669 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  44.78 
 
 		 763 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  40 
 
 		 617 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  48.65 
 
 		 643 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  40 
 
 		 617 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  42.11 
 
 		 628 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  38.46 
 
 		 630 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  44.93 
 
 		 626 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  49.23 
 
 		 852 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  40.54 
 
 		 673 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  40.54 
 
 		 670 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  48.61 
 
 		 407 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  54.41 
 
 		 620 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  37.84 
 
 		 670 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  50.75 
 
 		 639 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0021  sodium/hydrogen exchanger  37.88 
 
 		 484 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  40.79 
 
 		 617 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  52.24 
 
 		 629 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  44.59 
 
 		 666 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  34.72 
 
 		 612 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  41.89 
 
 		 660 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  41.89 
 
 		 660 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  41.89 
 
 		 660 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  41.89 
 
 		 660 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  46.15 
 
 		 652 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  46.15 
 
 		 652 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  42.65 
 
 		 640 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  41.33 
 
 		 702 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  41.89 
 
 		 719 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  43.48 
 
 		 569 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>