97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5585 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5585  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7958  response regulator receiver protein  70.25 
 
 		 124 aa  184  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5600  response regulator receiver protein  66.12 
 
 		 124 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.84 
 
 		 384 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.84 
 
 		 384 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  36.36 
 
 		 376 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0074  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5569  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.097054 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5902  response regulator receiver and SARP domain protein  40.82 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  39.8 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  39.8 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5770  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  38.37 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6170  hypothetical protein  41.98 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1555  hypothetical protein  36.54 
 
 		 168 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.17 
 
 		 846 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  35.09 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0432  hypothetical protein  40.74 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  36.25 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 1111 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  37.97 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5777  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0732019  hitchhiker  0.00995229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2623  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 602 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  36.14 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0073  response regulator receiver protein  35 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  32.41 
 
 		 1096 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 127 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.97 
 
 		 844 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6551  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  32.99 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  32.99 
 
 		 852 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  31.82 
 
 		 123 aa  48.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  34.69 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0114  response regulator receiver protein  32.47 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273159  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1154  response regulator receiver protein  28.04 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1001  response regulator receiver protein  28.04 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283402  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  27.68 
 
 		 847 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  30.84 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0220  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 444 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  30.1 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 631 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  26.55 
 
 		 847 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 559 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  29.9 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  29.9 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.44 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  32.29 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  32.29 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1262  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2922  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  32.74 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3610  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.12 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.12 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  25.66 
 
 		 847 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00619  two-component system regulatory protein  33.7 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  35.37 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 1096 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  27.43 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  28.97 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  29.52 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3106  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.3 
 
 		 704 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  25.44 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  32.91 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_003296  RS00402  putative two component response regulator transcription regulator protein  27.12 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00497843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1726  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  27.78 
 
 		 849 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  29.73 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2384  response regulator receiver  29.66 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00466139  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 136 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  35.37 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  31.71 
 
 		 126 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 126 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0539  two component response regulator  36.36 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.92 
 
 		 701 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 639 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5235  response regulator receiver protein  30.1 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0801642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  33.67 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  35.37 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2207  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.37 
 
 		 653 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>