More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5388 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  100 
 
 
288 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  90.62 
 
 
288 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  75.35 
 
 
291 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  73.96 
 
 
295 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  74.05 
 
 
295 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  73.7 
 
 
295 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  61.54 
 
 
290 aa  345  4e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  63.03 
 
 
290 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  61.19 
 
 
289 aa  330  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  63.29 
 
 
290 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  61.27 
 
 
291 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  61.97 
 
 
290 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  61.54 
 
 
289 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  60.21 
 
 
290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  64.16 
 
 
290 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  62.11 
 
 
288 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  61.89 
 
 
296 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  62.46 
 
 
288 aa  295  6e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  60.21 
 
 
289 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  59.86 
 
 
289 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  58.89 
 
 
300 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  57.55 
 
 
284 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  57.19 
 
 
286 aa  287  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  58.39 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  55 
 
 
284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  55.4 
 
 
284 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  54.55 
 
 
293 aa  280  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  57.6 
 
 
289 aa  277  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  57.88 
 
 
299 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  56.45 
 
 
290 aa  271  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  56.54 
 
 
294 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  58.48 
 
 
285 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  58.04 
 
 
290 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  55.59 
 
 
290 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  55.59 
 
 
290 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  56.69 
 
 
290 aa  248  6e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  55.27 
 
 
288 aa  247  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  56.83 
 
 
304 aa  242  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  48.54 
 
 
290 aa  240  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  53.45 
 
 
287 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  45.85 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  58.74 
 
 
295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  32.96 
 
 
278 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  32.96 
 
 
278 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.29 
 
 
280 aa  142  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  34.07 
 
 
289 aa  142  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  33.45 
 
 
312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  27.96 
 
 
279 aa  125  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  33.07 
 
 
306 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  29.14 
 
 
288 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  31.4 
 
 
278 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.64 
 
 
288 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  29.64 
 
 
288 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  29.64 
 
 
288 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  28.1 
 
 
280 aa  123  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  28.36 
 
 
277 aa  123  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  29.39 
 
 
288 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  32.12 
 
 
282 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  31.9 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  30.85 
 
 
300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  32.98 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  32.98 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  33.09 
 
 
285 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  31.18 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  27.24 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  31.95 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  28.41 
 
 
297 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  28.41 
 
 
297 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  28.41 
 
 
297 aa  113  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  30.69 
 
 
285 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
303 aa  112  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  33.56 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  25.86 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  31.06 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  31.77 
 
 
276 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  31.44 
 
 
285 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  29.86 
 
 
291 aa  109  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  28.21 
 
 
277 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  29.59 
 
 
286 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  29.03 
 
 
290 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  32.32 
 
 
283 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  29.03 
 
 
290 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  31.56 
 
 
279 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  30.58 
 
 
441 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  29.93 
 
 
415 aa  102  9e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  27.6 
 
 
297 aa  102  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  31.66 
 
 
285 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2146  hypothetical protein  32.14 
 
 
295 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  32.34 
 
 
280 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  32.35 
 
 
281 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  29.9 
 
 
441 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  25.09 
 
 
280 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  26.28 
 
 
292 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.21 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0908  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitD  31.7 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457468  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  34.31 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  29.84 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  29.45 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  29.3 
 
 
277 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0246  ABC-3 protein  32.08 
 
 
282 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>