More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5329 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
197 aa  387  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  82.74 
 
 
197 aa  317  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  63.21 
 
 
198 aa  223  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  60.62 
 
 
207 aa  202  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  60.62 
 
 
198 aa  202  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  61.26 
 
 
195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  47.92 
 
 
194 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  45.99 
 
 
196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  44.92 
 
 
196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  48.98 
 
 
199 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  45.36 
 
 
195 aa  160  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  45.95 
 
 
196 aa  157  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  47.67 
 
 
197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  48.19 
 
 
197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  40.61 
 
 
217 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  44.56 
 
 
197 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 
196 aa  148  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  47.62 
 
 
202 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  44.97 
 
 
197 aa  144  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  44.97 
 
 
196 aa  138  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  42.49 
 
 
205 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
188 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  43.01 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 
214 aa  94.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 
208 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  41.61 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  39.02 
 
 
200 aa  91.7  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  41.97 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 
195 aa  91.3  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  40.12 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  36.69 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  41.46 
 
 
224 aa  88.2  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  39.88 
 
 
222 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  34.22 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 
203 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  39.29 
 
 
251 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  39.88 
 
 
222 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 
196 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 
198 aa  85.5  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1088  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 
199 aa  84.7  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  41.28 
 
 
214 aa  84  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  35.18 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  37.72 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  37.72 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 
214 aa  82  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  39.89 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  37.21 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  45.1 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  37.28 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  39.18 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  38.69 
 
 
218 aa  79  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  40.49 
 
 
213 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  36.77 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  39.18 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  37.36 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
445 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.88 
 
 
203 aa  77  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  37.36 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  37.36 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  46.08 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  39.02 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  35.93 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  36.46 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  37.72 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 
591 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03630  6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-bisphosphatase bifunctional enzyme, putative  32.96 
 
 
658 aa  74.7  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  36.78 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  36.78 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  36.78 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  36.78 
 
 
229 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>