56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5273 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  100 
 
 		 285 aa  569  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  71.64 
 
 		 239 aa  359  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  53.88 
 
 		 223 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  72.03 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  67.21 
 
 		 242 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  67.21 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  31.14 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  31.09 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  31.45 
 
 		 225 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  31.36 
 
 		 221 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  29.34 
 
 		 228 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  30.56 
 
 		 225 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  40.18 
 
 		 207 aa  85.5  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  44.21 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  41.03 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  43.37 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0046  OstA family protein  29.22 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  28.31 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf462  hypothetical lipoprotein  41.44 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000141923  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0017  OstA family protein  38.36 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0062  OstA family protein  45.45 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  36 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  36.47 
 
 		 216 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  37.04 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  37.04 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  46.43 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  46.43 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1672  OstA family protein  35.9 
 
 		 323 aa  53.1  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0406  cell envelope biogenesis protein YhbN  45.45 
 
 		 187 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0336  OstA family protein  36.84 
 
 		 362 aa  52.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0497543  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0559  trans-sialidase  50.67 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  36.9 
 
 		 1446 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2341  OstA-like protein  46.55 
 
 		 191 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  37.88 
 
 		 200 aa  50.8  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  31.75 
 
 		 160 aa  49.7  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1160  hypothetical protein  43.04 
 
 		 566 aa  49.3  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0788241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1459 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0558  hypothetical protein  51.39 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.362885 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2772  OstA family protein  34.94 
 
 		 168 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4314  OstA family protein  30.19 
 
 		 186 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.257817 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  37.84 
 
 		 1454 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3223  OmpA/MotB domain-containing protein  61.9 
 
 		 441 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.943443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  34.95 
 
 		 174 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1441 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6961  hypothetical protein  56 
 
 		 600 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 705 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  34.38 
 
 		 170 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  38 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  41.67 
 
 		 787 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1372  hypothetical protein  44.93 
 
 		 344 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4300  OstA family protein  31.82 
 
 		 181 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3249  OstA-like protein  31.87 
 
 		 184 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4169  hypothetical protein  30.68 
 
 		 180 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4322  OstA family protein  31.82 
 
 		 181 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  29.86 
 
 		 197 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  28.87 
 
 		 180 aa  42.7  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.587032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>