47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5190 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 671 aa  1369    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 		 791 aa  171  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  35.16 
 
 		 873 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 		 856 aa  160  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 		 545 aa  157  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 725 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  34.37 
 
 		 787 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 		 774 aa  154  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  31.85 
 
 		 1644 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  31.85 
 
 		 1644 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 392 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 		 392 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.16 
 
 		 3301 aa  140  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 1386 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 867 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 1044 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 		 414 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  32.15 
 
 		 401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  31.65 
 
 		 916 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  27.36 
 
 		 383 aa  114  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 404 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2478  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 		 379 aa  107  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 		 624 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2706  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 373 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 		 679 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 357 aa  91.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 374 aa  90.9  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 		 359 aa  87.4  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2351  hypothetical protein  26.78 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0743287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 616 aa  81.3  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  27.27 
 
 		 1219 aa  78.2  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1232 aa  77.8  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2068  hypothetical protein  25.91 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.505538  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  36.17 
 
 		 1233 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  24.79 
 
 		 1635 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2023  glycosyl transferase, group 1  23.35 
 
 		 442 aa  52  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  27.35 
 
 		 365 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2348  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 		 411 aa  48.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0363579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3111  trehalose phosphorylase/synthase  27.08 
 
 		 420 aa  47.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3816  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 379 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 393 aa  47  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.51 
 
 		 388 aa  44.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 		 623 aa  43.9  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>