More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5170 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
688 aa  1345    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  86.2 
 
 
699 aa  1082    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.82 
 
 
721 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115994  normal  0.0775846 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2043  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.38 
 
 
691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10086  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2474  histidine kinase  64.27 
 
 
559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.369133 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5394  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  57.66 
 
 
558 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0211479 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5110  histidine kinase  58.06 
 
 
558 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  0.0814675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.09 
 
 
651 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4603  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.1 
 
 
783 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2057  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.24 
 
 
774 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.906607  hitchhiker  0.00133985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.08 
 
 
653 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  47.36 
 
 
678 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.27 
 
 
642 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.16 
 
 
660 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.43 
 
 
766 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.72 
 
 
642 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.44 
 
 
650 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 
696 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.5 
 
 
766 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  48.88 
 
 
858 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  64.41 
 
 
499 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  37.07 
 
 
695 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.73 
 
 
927 aa  365  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 
688 aa  361  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
695 aa  360  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3125  putative sensor/response regulator hybrid  43.94 
 
 
650 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36420  putative sensor/response regulator hybrid  43.64 
 
 
699 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426849  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 
632 aa  352  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 
998 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  42.19 
 
 
847 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 
686 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  50.26 
 
 
1164 aa  343  8e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.26 
 
 
1164 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 
702 aa  340  8e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.42 
 
 
650 aa  337  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.19 
 
 
858 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.53 
 
 
830 aa  336  9e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5576  histidine kinase  47.48 
 
 
529 aa  336  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0252292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2691  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 
639 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.87 
 
 
951 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  39.39 
 
 
676 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 
703 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4151  sensor histidine kinase/response regulator hybrid  46.62 
 
 
571 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.579562  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  39.82 
 
 
956 aa  324  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
689 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  38.97 
 
 
676 aa  320  5e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 
812 aa  320  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.82 
 
 
807 aa  320  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  39.27 
 
 
827 aa  317  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.08 
 
 
887 aa  317  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4430  GAF sensor hybrid histidine kinase  49.25 
 
 
571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  40.91 
 
 
691 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.11 
 
 
1067 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 
814 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  43.01 
 
 
691 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 
966 aa  309  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.61 
 
 
806 aa  308  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2251  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.55 
 
 
721 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0770498  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
1013 aa  305  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5761  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 
708 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
943 aa  305  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  36.9 
 
 
622 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
622 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 
949 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 
943 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  39.67 
 
 
949 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 
622 aa  303  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.86 
 
 
845 aa  301  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 
622 aa  300  8e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.97 
 
 
999 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.1 
 
 
957 aa  296  8e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  45.35 
 
 
575 aa  296  9e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 
640 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 
551 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  47.32 
 
 
701 aa  294  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  36.99 
 
 
1036 aa  295  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 
1050 aa  293  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.76 
 
 
889 aa  292  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.01 
 
 
720 aa  292  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  47.1 
 
 
575 aa  291  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2026  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 
964 aa  291  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.85 
 
 
789 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.85 
 
 
789 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  43.26 
 
 
573 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
789 aa  290  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  43.86 
 
 
646 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
548 aa  289  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 
1381 aa  289  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.6 
 
 
701 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4711  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 
683 aa  289  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 
628 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0038  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 
681 aa  287  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0323591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 
1646 aa  287  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 
1651 aa  287  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  42.76 
 
 
571 aa  287  5.999999999999999e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 
1036 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0036  histidine kinase  41.65 
 
 
556 aa  286  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.526737  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.96 
 
 
1089 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.54 
 
 
1631 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
643 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>