30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5119 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5119  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 446 aa  789    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0145364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6064  flagellar hook-length control protein  77.69 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467248  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4095  flagellar hook-length control protein  58.94 
 
 		 463 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4463  flagellar hook-length control protein  57.62 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5062  flagellar hook-length control protein  50.96 
 
 		 526 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0694  flagellar hook-length control protein  43.5 
 
 		 525 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3963  flagellar hook-length control protein  46.58 
 
 		 526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.687066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0986  flagellar hook-length control protein  44.14 
 
 		 534 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0602  flagellar hook-length control protein  48.97 
 
 		 528 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4117  flagellar hook-length control protein  45.21 
 
 		 525 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1880  putative flagellar hook length determination protein  41.44 
 
 		 542 aa  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2187  flagellar hook-length control protein  39.08 
 
 		 495 aa  108  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1495  flagellar hook-length control protein  42.86 
 
 		 532 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0690  flagellar hook-length control protein  49.41 
 
 		 641 aa  80.9  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464695 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0548  flagellar hook-length control protein  39.76 
 
 		 607 aa  67  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1008  flagellar hook-length control protein  31.21 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345301  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0004  hypothetical protein  36.13 
 
 		 739 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1335  hypothetical protein  36.13 
 
 		 739 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  40.51 
 
 		 552 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  34.21 
 
 		 686 aa  50.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3364  putative flagellar hook-length control protein  35.71 
 
 		 778 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1677  hypothetical protein  37.88 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107938  normal  0.0571182 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  32.89 
 
 		 623 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  32.84 
 
 		 580 aa  46.6  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  34.83 
 
 		 656 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2596  hypothetical protein  34.83 
 
 		 338 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.440368  hitchhiker  0.00000208928 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3832  flagellar hook-length control protein  30.68 
 
 		 660 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4305  DNA topoisomerase I  38.68 
 
 		 1049 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4206  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 612 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2303  polar flagellar hook-length control protein FliK  23.89 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>