75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5019 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  100 
 
 		 179 aa  360  8e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  88.83 
 
 		 179 aa  298  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  75.47 
 
 		 176 aa  243  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  67.55 
 
 		 187 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  72.96 
 
 		 176 aa  236  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  72.33 
 
 		 176 aa  235  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  64.38 
 
 		 178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  66.45 
 
 		 183 aa  207  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  55.11 
 
 		 175 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  55.84 
 
 		 177 aa  168  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  53.12 
 
 		 178 aa  161  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  53.8 
 
 		 173 aa  157  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  55.92 
 
 		 185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  46.82 
 
 		 177 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  46.91 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  45.81 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  47.4 
 
 		 181 aa  144  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  48.73 
 
 		 184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  48.7 
 
 		 176 aa  144  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  45.25 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  46.39 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  46.75 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  47.4 
 
 		 176 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  46.75 
 
 		 176 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  43.21 
 
 		 176 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  41.72 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  44.44 
 
 		 176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  34.46 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  41.92 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  34.75 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  36.78 
 
 		 167 aa  97.8  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  38.93 
 
 		 166 aa  93.2  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  39.33 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  49.52 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  38 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  36.88 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  37.84 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  33.81 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  32.14 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  32.14 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  32.61 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  32.61 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  32.61 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  32.61 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  32.61 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  32.61 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  32.61 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  31.88 
 
 		 138 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  31.69 
 
 		 136 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  30.52 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  23.65 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  30.92 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  31.06 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  29.33 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  28.87 
 
 		 138 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  27.46 
 
 		 138 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  27.46 
 
 		 138 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  28.77 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9280  hypothetical protein  27.15 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0713  hypothetical protein  26.67 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  27.89 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  31.78 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  26.9 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4793  hypothetical protein  26.67 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  29.91 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  29.91 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  29.91 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  29.91 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  29.91 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  29.91 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  28.68 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  24.16 
 
 		 138 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  24.83 
 
 		 142 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>