More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5006 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 267 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  81.4 
 
 		 264 aa  349  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  54.17 
 
 		 266 aa  239  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  51.39 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  49.12 
 
 		 1033 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  40.36 
 
 		 517 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  38.75 
 
 		 449 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  47.21 
 
 		 277 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  41.55 
 
 		 441 aa  96.3  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  39.42 
 
 		 493 aa  96.3  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  39.41 
 
 		 336 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  39.41 
 
 		 336 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  40.59 
 
 		 576 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  36.17 
 
 		 862 aa  94  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  39.79 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  37.56 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  34.85 
 
 		 401 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  34.85 
 
 		 401 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  35.78 
 
 		 351 aa  92  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  40.11 
 
 		 218 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  43.24 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  32.94 
 
 		 381 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  37.69 
 
 		 320 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  40.1 
 
 		 493 aa  89.7  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  40.96 
 
 		 332 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  37.12 
 
 		 386 aa  89  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  39.7 
 
 		 340 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  35.68 
 
 		 1191 aa  89  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  43.09 
 
 		 213 aa  89  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  40.5 
 
 		 389 aa  89  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  37.86 
 
 		 333 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  37.63 
 
 		 489 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  40.64 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  34.93 
 
 		 448 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  43.75 
 
 		 184 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  38.2 
 
 		 483 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  37.44 
 
 		 515 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  36.95 
 
 		 311 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  41.71 
 
 		 521 aa  85.5  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  40.82 
 
 		 745 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 		 567 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  40.11 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  39.67 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  36.96 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  39.41 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  43.16 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  33.18 
 
 		 600 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  29.41 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  39.02 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  41.05 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  39.02 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  37.55 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  36.41 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  37.81 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  46.02 
 
 		 433 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  36.8 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  36.53 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  35.42 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  41.62 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  35.42 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  37.14 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  35.62 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  39.5 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  40.49 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  36.82 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  35.47 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  35.47 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  39.11 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  39.33 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  39.08 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  43.75 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  40.35 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  40.12 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  46.81 
 
 		 973 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  40.22 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  39.68 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  48.98 
 
 		 408 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  36.4 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  40.22 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  37.44 
 
 		 706 aa  79.3  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  42.17 
 
 		 438 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  36.96 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  32.39 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  38.52 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  32.46 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  34.93 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  47.45 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  34.78 
 
 		 872 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  40.11 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  40.72 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  34.67 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  40.43 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  40.72 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  41.24 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  35.53 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  34.65 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  34.3 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.33 
 
 		 525 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>