129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4987 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  100 
 
 
431 aa  892    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  58.92 
 
 
413 aa  531  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  59.17 
 
 
413 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  58.48 
 
 
415 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  57.7 
 
 
411 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  56.48 
 
 
411 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  56 
 
 
420 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  53.7 
 
 
433 aa  475  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  55.06 
 
 
411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  53.22 
 
 
433 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  54.3 
 
 
412 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  55.8 
 
 
407 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  55.56 
 
 
407 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  54.7 
 
 
409 aa  455  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  55.56 
 
 
407 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  54.57 
 
 
407 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  54.7 
 
 
409 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  54.57 
 
 
420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  54.46 
 
 
409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  52 
 
 
416 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  51.01 
 
 
400 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  52.58 
 
 
407 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  49.13 
 
 
408 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  47.54 
 
 
408 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  49.75 
 
 
407 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  47.65 
 
 
411 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  49.51 
 
 
409 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  50 
 
 
406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  48.03 
 
 
407 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  52.16 
 
 
373 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  47 
 
 
413 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  50.26 
 
 
413 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  45.56 
 
 
438 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  49.23 
 
 
410 aa  363  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  42.47 
 
 
402 aa  343  5e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  42.48 
 
 
409 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  44.63 
 
 
415 aa  340  4e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  43.87 
 
 
410 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  45.43 
 
 
410 aa  326  5e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  43.98 
 
 
444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  44.01 
 
 
410 aa  310  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  43.58 
 
 
427 aa  308  9e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  36.12 
 
 
407 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  37.53 
 
 
419 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.83 
 
 
421 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  32.76 
 
 
400 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  35.29 
 
 
408 aa  242  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  33 
 
 
400 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  34.31 
 
 
408 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  34.07 
 
 
406 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  30.17 
 
 
418 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  34.47 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  30.96 
 
 
400 aa  180  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  29.1 
 
 
416 aa  177  3e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  29.02 
 
 
409 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  25.9 
 
 
436 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  26.43 
 
 
412 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  26.19 
 
 
412 aa  156  7e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  25.06 
 
 
409 aa  153  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  25.51 
 
 
413 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  23.61 
 
 
396 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  25 
 
 
406 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  26.25 
 
 
376 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  35.58 
 
 
178 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  25.78 
 
 
817 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  26.67 
 
 
406 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  25.95 
 
 
391 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  24.17 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  25.37 
 
 
406 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  26.87 
 
 
359 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  23.53 
 
 
396 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  26.7 
 
 
414 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  23.75 
 
 
414 aa  77  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  20.56 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  21.05 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  24.73 
 
 
425 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  22.93 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  23.06 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  23.11 
 
 
383 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  20.44 
 
 
401 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  34 
 
 
305 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  27.33 
 
 
303 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  20.29 
 
 
411 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  20.66 
 
 
379 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  23.19 
 
 
282 aa  57  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  20.69 
 
 
401 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  22.92 
 
 
310 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  27.59 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  27.59 
 
 
303 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  22.22 
 
 
277 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  22.13 
 
 
352 aa  54.3  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  19.73 
 
 
401 aa  53.5  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1581  methyltransferase type 11  24.68 
 
 
232 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000326286  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  25.09 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  24.86 
 
 
306 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  22.22 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
1177 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0369  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.42 
 
 
248 aa  50.8  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  22.75 
 
 
298 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  21.58 
 
 
415 aa  50.4  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>