More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4940 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4940  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
233 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4969  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  84.89 
 
 
231 aa  354  5.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4935  Thiamine-phosphate diphosphorylase  72.89 
 
 
241 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.539276  normal  0.373697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4471  thiamine-phosphate diphosphorylase  72.89 
 
 
241 aa  265  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4985  Thiamine-phosphate diphosphorylase  74.22 
 
 
242 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.399872  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1959  thiamine-phosphate diphosphorylase  71.12 
 
 
248 aa  246  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155304  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.45 
 
 
219 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.57 
 
 
215 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.72 
 
 
213 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0900  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.92 
 
 
219 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.74 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  41.23 
 
 
204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.99 
 
 
211 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.08 
 
 
211 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.86 
 
 
221 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.87 
 
 
205 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.55 
 
 
236 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.8 
 
 
204 aa  134  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.9 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.72 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.68 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  39.81 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.74 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.4 
 
 
211 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0281488  normal  0.147904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.62 
 
 
220 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.57 
 
 
218 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6680  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.54 
 
 
211 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  0.587855 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.78 
 
 
215 aa  119  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  42.13 
 
 
478 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.92 
 
 
211 aa  118  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.95 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.67 
 
 
214 aa  116  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.35 
 
 
211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.91 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  43.45 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.94 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.01 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0261  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.32 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.243144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.14 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.77 
 
 
197 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.31 
 
 
204 aa  112  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.19 
 
 
214 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.02 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.2 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.96 
 
 
219 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77822  predicted protein  33.8 
 
 
533 aa  109  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00729956  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.17 
 
 
220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2056  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.26 
 
 
216 aa  108  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.81 
 
 
223 aa  109  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  43.08 
 
 
479 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1139  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.75 
 
 
226 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.123471 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0687  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.46 
 
 
222 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.46 
 
 
217 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.57 
 
 
206 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0584  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.3 
 
 
203 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.143376  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5185  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.69 
 
 
228 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  42.02 
 
 
490 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.88 
 
 
356 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.04 
 
 
352 aa  106  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.44 
 
 
208 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.92 
 
 
206 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.53 
 
 
216 aa  105  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.51 
 
 
203 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.07 
 
 
213 aa  105  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2301  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.44 
 
 
203 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.127394 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0648  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.44 
 
 
203 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.29 
 
 
206 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0842  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.62 
 
 
223 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.32 
 
 
252 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  39.29 
 
 
492 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5050  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.21 
 
 
219 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0276  hypothetical protein  32.81 
 
 
212 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  43.02 
 
 
497 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.2 
 
 
344 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.4 
 
 
213 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2205  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.9 
 
 
220 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.24 
 
 
234 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  38.76 
 
 
484 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.05 
 
 
224 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.6 
 
 
219 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0403  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.35 
 
 
211 aa  102  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.647684  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.81 
 
 
379 aa  101  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.72 
 
 
219 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  39.89 
 
 
484 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.33 
 
 
207 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.96 
 
 
346 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  39.7 
 
 
206 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.38 
 
 
220 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.4 
 
 
209 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3030  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.71 
 
 
226 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0235882  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.81 
 
 
206 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.96 
 
 
219 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.26 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.04 
 
 
352 aa  99.8  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.26 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  40.31 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0853  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.93 
 
 
213 aa  99.4  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230824  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.12 
 
 
205 aa  99  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.44 
 
 
221 aa  98.6  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3685  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.09 
 
 
210 aa  98.6  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>