59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4909 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 313 aa  618  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  81.47 
 
 		 332 aa  434  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  59.42 
 
 		 302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  57.59 
 
 		 315 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  55.8 
 
 		 314 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  56.74 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  54.82 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  50.57 
 
 		 227 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  46.46 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  46.82 
 
 		 257 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  50.3 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  50.29 
 
 		 317 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  46.2 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  50.66 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.77 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  50.9 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  42.69 
 
 		 220 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.77 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.88 
 
 		 216 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.17 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  40.39 
 
 		 258 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  42.86 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  39.9 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  42.24 
 
 		 222 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.12 
 
 		 222 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.02 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  38.98 
 
 		 210 aa  120  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.63 
 
 		 212 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.71 
 
 		 223 aa  96.3  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.73 
 
 		 221 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.59 
 
 		 212 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  36.59 
 
 		 212 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  37.8 
 
 		 203 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.98 
 
 		 212 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.54 
 
 		 206 aa  87.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.97 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.65 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.18 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.89 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  30.63 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0846  hypothetical protein  31.82 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.07 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.18 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.22 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.63 
 
 		 205 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  27.19 
 
 		 193 aa  54.7  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0547  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.37 
 
 		 230 aa  52.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117593  hitchhiker  0.000046415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0377  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  26.37 
 
 		 230 aa  52.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.12 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.38 
 
 		 214 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.62 
 
 		 208 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.04 
 
 		 208 aa  49.7  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6863  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.69 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.36 
 
 		 202 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2555  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.87 
 
 		 215 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2151  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.87 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100483  normal  0.437177 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.38 
 
 		 202 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.47 
 
 		 223 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2003  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.82 
 
 		 205 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>